Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUU8

Tnip1, TNFAIP3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip1Q9WUU8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnip1Q9WUU8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnip1Q9WUU8 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnip1Q9WUU8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnip1Q9WUU8 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnip1Q9WUU8 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnip1Q9WUU8 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnip1Q9WUU8 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnip1Q9WUU8 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnip1Q9WUU8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnip1Q9WUU8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnip1Q9WUU8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnip1Q9WUU8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnip1Q9WUU8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnip1Q9WUU8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnip1Q9WUU8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnip1Q9WUU8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnip1Q9WUU8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnip1Q9WUU8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnip1Q9WUU8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnip1Q9WUU8 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnip1Q9WUU8 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnip1Q9WUU8 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnip1Q9WUU8 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnip1Q9WUU8 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnip1Q9WUU8 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnip1Q9WUU8 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnip1Q9WUU8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnip1Q9WUU8 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnip1Q9WUU8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnip1Q9WUU8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnip1Q9WUU8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnip1Q9WUU8 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnip1Q9WUU8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnip1Q9WUU8 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnip1Q9WUU8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnip1Q9WUU8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnip1Q9WUU8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnip1Q9WUU8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnip1Q9WUU8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnip1Q9WUU8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnip1Q9WUU8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnip1Q9WUU8 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnip1Q9WUU8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnip1Q9WUU8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnip1Q9WUU8 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnip1Q9WUU8 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnip1Q9WUU8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnip1Q9WUU8 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnip1Q9WUU8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnip1Q9WUU8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnip1Q9WUU8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnip1Q9WUU8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnip1Q9WUU8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnip1Q9WUU8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnip1Q9WUU8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnip1Q9WUU8 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnip1Q9WUU8 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnip1Q9WUU8 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnip1Q9WUU8 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnip1Q9WUU8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnip1Q9WUU8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnip1Q9WUU8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tnip1Q9WUU8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tnip1Q9WUU8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tnip1Q9WUU8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnip1Q9WUU8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnip1Q9WUU8 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnip1Q9WUU8 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnip1Q9WUU8 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnip1Q9WUU8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnip1Q9WUU8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnip1Q9WUU8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnip1Q9WUU8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnip1Q9WUU8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnip1Q9WUU8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnip1Q9WUU8 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnip1Q9WUU8 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnip1Q9WUU8 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnip1Q9WUU8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnip1Q9WUU8 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnip1Q9WUU8 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnip1Q9WUU8 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnip1Q9WUU8 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnip1Q9WUU8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnip1Q9WUU8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnip1Q9WUU8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnip1Q9WUU8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnip1Q9WUU8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnip1Q9WUU8 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnip1Q9WUU8 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnip1Q9WUU8 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnip1Q9WUU8 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnip1Q9WUU8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnip1Q9WUU8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnip1Q9WUU8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnip1Q9WUU8 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnip1Q9WUU8 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnip1Q9WUU8 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnip1Q9WUU8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms