Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUI0

Mixl1, Homeobox protein MIXL1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mixl1Q9WUI0 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mixl1Q9WUI0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mixl1Q9WUI0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mixl1Q9WUI0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mixl1Q9WUI0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mixl1Q9WUI0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mixl1Q9WUI0 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mixl1Q9WUI0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mixl1Q9WUI0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mixl1Q9WUI0 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mixl1Q9WUI0 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mixl1Q9WUI0 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mixl1Q9WUI0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mixl1Q9WUI0 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mixl1Q9WUI0 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mixl1Q9WUI0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mixl1Q9WUI0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mixl1Q9WUI0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mixl1Q9WUI0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mixl1Q9WUI0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mixl1Q9WUI0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mixl1Q9WUI0 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mixl1Q9WUI0 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mixl1Q9WUI0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mixl1Q9WUI0 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mixl1Q9WUI0 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mixl1Q9WUI0 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mixl1Q9WUI0 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mixl1Q9WUI0 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mixl1Q9WUI0 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mixl1Q9WUI0 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mixl1Q9WUI0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mixl1Q9WUI0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mixl1Q9WUI0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mixl1Q9WUI0 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Mixl1Q9WUI0 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mixl1Q9WUI0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mixl1Q9WUI0 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mixl1Q9WUI0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mixl1Q9WUI0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mixl1Q9WUI0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mixl1Q9WUI0 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mixl1Q9WUI0 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mixl1Q9WUI0 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mixl1Q9WUI0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mixl1Q9WUI0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mixl1Q9WUI0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mixl1Q9WUI0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mixl1Q9WUI0 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mixl1Q9WUI0 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mixl1Q9WUI0 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mixl1Q9WUI0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Mixl1Q9WUI0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mixl1Q9WUI0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mixl1Q9WUI0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mixl1Q9WUI0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mixl1Q9WUI0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mixl1Q9WUI0 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mixl1Q9WUI0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mixl1Q9WUI0 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Mixl1Q9WUI0 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mixl1Q9WUI0 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mixl1Q9WUI0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mixl1Q9WUI0 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mixl1Q9WUI0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mixl1Q9WUI0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mixl1Q9WUI0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mixl1Q9WUI0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mixl1Q9WUI0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Mixl1Q9WUI0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mixl1Q9WUI0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mixl1Q9WUI0 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mixl1Q9WUI0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mixl1Q9WUI0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mixl1Q9WUI0 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mixl1Q9WUI0 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mixl1Q9WUI0 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mixl1Q9WUI0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mixl1Q9WUI0 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mixl1Q9WUI0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mixl1Q9WUI0 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mixl1Q9WUI0 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mixl1Q9WUI0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mixl1Q9WUI0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mixl1Q9WUI0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mixl1Q9WUI0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mixl1Q9WUI0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mixl1Q9WUI0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mixl1Q9WUI0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mixl1Q9WUI0 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mixl1Q9WUI0 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mixl1Q9WUI0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mixl1Q9WUI0 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mixl1Q9WUI0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mixl1Q9WUI0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mixl1Q9WUI0 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mixl1Q9WUI0 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mixl1Q9WUI0 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mixl1Q9WUI0 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mixl1Q9WUI0 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms