Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU40

Lemd3, Inner nuclear membrane protein Man1, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lemd3Q9WU40 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Lemd3Q9WU40 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Lemd3Q9WU40 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Lemd3Q9WU40 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Lemd3Q9WU40 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Lemd3Q9WU40 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Lemd3Q9WU40 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Lemd3Q9WU40 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Lemd3Q9WU40 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Lemd3Q9WU40 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Lemd3Q9WU40 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Lemd3Q9WU40 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Lemd3Q9WU40 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Lemd3Q9WU40 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Lemd3Q9WU40 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Lemd3Q9WU40 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Lemd3Q9WU40 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Lemd3Q9WU40 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Lemd3Q9WU40 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Lemd3Q9WU40 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Lemd3Q9WU40 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Lemd3Q9WU40 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Lemd3Q9WU40 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Lemd3Q9WU40 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Lemd3Q9WU40 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Lemd3Q9WU40 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Lemd3Q9WU40 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Lemd3Q9WU40 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Lemd3Q9WU40 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Lemd3Q9WU40 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Lemd3Q9WU40 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Lemd3Q9WU40 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Lemd3Q9WU40 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Lemd3Q9WU40 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Lemd3Q9WU40 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Lemd3Q9WU40 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Lemd3Q9WU40 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Lemd3Q9WU40 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lemd3Q9WU40 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lemd3Q9WU40 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lemd3Q9WU40 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lemd3Q9WU40 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lemd3Q9WU40 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lemd3Q9WU40 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lemd3Q9WU40 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Lemd3Q9WU40 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Lemd3Q9WU40 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Lemd3Q9WU40 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Lemd3Q9WU40 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Lemd3Q9WU40 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Lemd3Q9WU40 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Lemd3Q9WU40 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Lemd3Q9WU40 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Lemd3Q9WU40 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lemd3Q9WU40 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lemd3Q9WU40 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lemd3Q9WU40 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Lemd3Q9WU40 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lemd3Q9WU40 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lemd3Q9WU40 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lemd3Q9WU40 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lemd3Q9WU40 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lemd3Q9WU40 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Lemd3Q9WU40 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Lemd3Q9WU40 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Lemd3Q9WU40 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Lemd3Q9WU40 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Lemd3Q9WU40 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Lemd3Q9WU40 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Lemd3Q9WU40 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Lemd3Q9WU40 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Lemd3Q9WU40 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Lemd3Q9WU40 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lemd3Q9WU40 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lemd3Q9WU40 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lemd3Q9WU40 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lemd3Q9WU40 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lemd3Q9WU40 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lemd3Q9WU40 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lemd3Q9WU40 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Lemd3Q9WU40 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Lemd3Q9WU40 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Lemd3Q9WU40 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Lemd3Q9WU40 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Lemd3Q9WU40 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Lemd3Q9WU40 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Lemd3Q9WU40 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Lemd3Q9WU40 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Lemd3Q9WU40 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Lemd3Q9WU40 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Lemd3Q9WU40 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Lemd3Q9WU40 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Lemd3Q9WU40 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Lemd3Q9WU40 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Lemd3Q9WU40 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Lemd3Q9WU40 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Lemd3Q9WU40 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Lemd3Q9WU40 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Lemd3Q9WU40 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Lemd3Q9WU40 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms