Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU12

Snurf, SNRPN upstream reading frame protein, mousemouse

Predictions only

Length 71 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnurfQ9WU12 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SnurfQ9WU12 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
SnurfQ9WU12 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SnurfQ9WU12 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SnurfQ9WU12 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SnurfQ9WU12 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SnurfQ9WU12 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SnurfQ9WU12 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SnurfQ9WU12 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SnurfQ9WU12 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SnurfQ9WU12 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SnurfQ9WU12 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SnurfQ9WU12 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SnurfQ9WU12 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SnurfQ9WU12 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SnurfQ9WU12 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SnurfQ9WU12 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SnurfQ9WU12 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SnurfQ9WU12 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SnurfQ9WU12 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SnurfQ9WU12 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SnurfQ9WU12 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SnurfQ9WU12 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SnurfQ9WU12 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SnurfQ9WU12 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SnurfQ9WU12 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SnurfQ9WU12 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
SnurfQ9WU12 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SnurfQ9WU12 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SnurfQ9WU12 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SnurfQ9WU12 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SnurfQ9WU12 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SnurfQ9WU12 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SnurfQ9WU12 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SnurfQ9WU12 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
SnurfQ9WU12 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SnurfQ9WU12 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SnurfQ9WU12 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SnurfQ9WU12 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SnurfQ9WU12 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SnurfQ9WU12 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SnurfQ9WU12 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SnurfQ9WU12 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SnurfQ9WU12 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SnurfQ9WU12 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SnurfQ9WU12 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SnurfQ9WU12 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SnurfQ9WU12 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SnurfQ9WU12 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SnurfQ9WU12 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SnurfQ9WU12 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SnurfQ9WU12 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SnurfQ9WU12 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
SnurfQ9WU12 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SnurfQ9WU12 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SnurfQ9WU12 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SnurfQ9WU12 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SnurfQ9WU12 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SnurfQ9WU12 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SnurfQ9WU12 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SnurfQ9WU12 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SnurfQ9WU12 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SnurfQ9WU12 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SnurfQ9WU12 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SnurfQ9WU12 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SnurfQ9WU12 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SnurfQ9WU12 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SnurfQ9WU12 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SnurfQ9WU12 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SnurfQ9WU12 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SnurfQ9WU12 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SnurfQ9WU12 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SnurfQ9WU12 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SnurfQ9WU12 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SnurfQ9WU12 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SnurfQ9WU12 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SnurfQ9WU12 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SnurfQ9WU12 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SnurfQ9WU12 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SnurfQ9WU12 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SnurfQ9WU12 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SnurfQ9WU12 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SnurfQ9WU12 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SnurfQ9WU12 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SnurfQ9WU12 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SnurfQ9WU12 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SnurfQ9WU12 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SnurfQ9WU12 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SnurfQ9WU12 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SnurfQ9WU12 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SnurfQ9WU12 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SnurfQ9WU12 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SnurfQ9WU12 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SnurfQ9WU12 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SnurfQ9WU12 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SnurfQ9WU12 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SnurfQ9WU12 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SnurfQ9WU12 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SnurfQ9WU12 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SnurfQ9WU12 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms