Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU00

Nrf1, Nuclear respiratory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrf1Q9WU00 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nrf1Q9WU00 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Nrf1Q9WU00 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nrf1Q9WU00 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nrf1Q9WU00 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nrf1Q9WU00 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nrf1Q9WU00 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nrf1Q9WU00 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nrf1Q9WU00 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nrf1Q9WU00 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nrf1Q9WU00 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nrf1Q9WU00 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nrf1Q9WU00 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nrf1Q9WU00 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nrf1Q9WU00 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nrf1Q9WU00 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nrf1Q9WU00 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nrf1Q9WU00 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nrf1Q9WU00 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nrf1Q9WU00 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nrf1Q9WU00 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Nrf1Q9WU00 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nrf1Q9WU00 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nrf1Q9WU00 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nrf1Q9WU00 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nrf1Q9WU00 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Nrf1Q9WU00 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nrf1Q9WU00 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nrf1Q9WU00 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nrf1Q9WU00 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nrf1Q9WU00 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nrf1Q9WU00 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Nrf1Q9WU00 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nrf1Q9WU00 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nrf1Q9WU00 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nrf1Q9WU00 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nrf1Q9WU00 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Nrf1Q9WU00 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nrf1Q9WU00 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nrf1Q9WU00 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nrf1Q9WU00 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nrf1Q9WU00 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nrf1Q9WU00 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nrf1Q9WU00 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nrf1Q9WU00 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nrf1Q9WU00 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Nrf1Q9WU00 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nrf1Q9WU00 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nrf1Q9WU00 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Nrf1Q9WU00 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nrf1Q9WU00 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nrf1Q9WU00 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nrf1Q9WU00 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nrf1Q9WU00 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nrf1Q9WU00 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nrf1Q9WU00 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nrf1Q9WU00 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nrf1Q9WU00 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nrf1Q9WU00 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nrf1Q9WU00 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nrf1Q9WU00 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nrf1Q9WU00 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nrf1Q9WU00 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nrf1Q9WU00 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nrf1Q9WU00 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nrf1Q9WU00 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nrf1Q9WU00 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nrf1Q9WU00 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nrf1Q9WU00 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nrf1Q9WU00 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nrf1Q9WU00 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nrf1Q9WU00 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nrf1Q9WU00 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nrf1Q9WU00 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nrf1Q9WU00 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nrf1Q9WU00 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nrf1Q9WU00 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nrf1Q9WU00 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nrf1Q9WU00 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nrf1Q9WU00 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nrf1Q9WU00 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nrf1Q9WU00 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nrf1Q9WU00 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nrf1Q9WU00 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nrf1Q9WU00 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nrf1Q9WU00 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nrf1Q9WU00 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nrf1Q9WU00 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nrf1Q9WU00 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nrf1Q9WU00 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nrf1Q9WU00 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nrf1Q9WU00 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nrf1Q9WU00 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nrf1Q9WU00 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nrf1Q9WU00 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nrf1Q9WU00 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nrf1Q9WU00 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nrf1Q9WU00 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nrf1Q9WU00 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nrf1Q9WU00 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.4 ms