Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTP9

Vax2, Ventral anterior homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax2Q9WTP9 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vax2Q9WTP9 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vax2Q9WTP9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vax2Q9WTP9 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vax2Q9WTP9 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vax2Q9WTP9 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vax2Q9WTP9 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vax2Q9WTP9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Vax2Q9WTP9 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vax2Q9WTP9 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vax2Q9WTP9 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vax2Q9WTP9 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vax2Q9WTP9 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vax2Q9WTP9 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vax2Q9WTP9 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vax2Q9WTP9 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vax2Q9WTP9 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vax2Q9WTP9 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vax2Q9WTP9 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vax2Q9WTP9 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vax2Q9WTP9 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vax2Q9WTP9 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Vax2Q9WTP9 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vax2Q9WTP9 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vax2Q9WTP9 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vax2Q9WTP9 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vax2Q9WTP9 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vax2Q9WTP9 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vax2Q9WTP9 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vax2Q9WTP9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vax2Q9WTP9 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vax2Q9WTP9 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Vax2Q9WTP9 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vax2Q9WTP9 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vax2Q9WTP9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vax2Q9WTP9 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vax2Q9WTP9 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vax2Q9WTP9 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vax2Q9WTP9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vax2Q9WTP9 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vax2Q9WTP9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vax2Q9WTP9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vax2Q9WTP9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Vax2Q9WTP9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vax2Q9WTP9 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vax2Q9WTP9 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vax2Q9WTP9 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vax2Q9WTP9 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vax2Q9WTP9 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vax2Q9WTP9 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vax2Q9WTP9 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vax2Q9WTP9 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vax2Q9WTP9 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vax2Q9WTP9 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vax2Q9WTP9 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vax2Q9WTP9 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vax2Q9WTP9 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vax2Q9WTP9 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vax2Q9WTP9 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vax2Q9WTP9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vax2Q9WTP9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vax2Q9WTP9 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vax2Q9WTP9 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vax2Q9WTP9 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vax2Q9WTP9 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vax2Q9WTP9 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vax2Q9WTP9 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vax2Q9WTP9 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vax2Q9WTP9 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vax2Q9WTP9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vax2Q9WTP9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vax2Q9WTP9 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vax2Q9WTP9 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vax2Q9WTP9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Vax2Q9WTP9 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vax2Q9WTP9 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vax2Q9WTP9 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vax2Q9WTP9 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vax2Q9WTP9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vax2Q9WTP9 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vax2Q9WTP9 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Vax2Q9WTP9 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vax2Q9WTP9 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vax2Q9WTP9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vax2Q9WTP9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vax2Q9WTP9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vax2Q9WTP9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vax2Q9WTP9 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vax2Q9WTP9 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vax2Q9WTP9 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vax2Q9WTP9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vax2Q9WTP9 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vax2Q9WTP9 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vax2Q9WTP9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vax2Q9WTP9 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vax2Q9WTP9 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vax2Q9WTP9 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vax2Q9WTP9 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vax2Q9WTP9 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vax2Q9WTP9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms