Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sema6cQ9WTM3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sema6cQ9WTM3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sema6cQ9WTM3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sema6cQ9WTM3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sema6cQ9WTM3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sema6cQ9WTM3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sema6cQ9WTM3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sema6cQ9WTM3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sema6cQ9WTM3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sema6cQ9WTM3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sema6cQ9WTM3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sema6cQ9WTM3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sema6cQ9WTM3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sema6cQ9WTM3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sema6cQ9WTM3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sema6cQ9WTM3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sema6cQ9WTM3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sema6cQ9WTM3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sema6cQ9WTM3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sema6cQ9WTM3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sema6cQ9WTM3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sema6cQ9WTM3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sema6cQ9WTM3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sema6cQ9WTM3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sema6cQ9WTM3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sema6cQ9WTM3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sema6cQ9WTM3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sema6cQ9WTM3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sema6cQ9WTM3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sema6cQ9WTM3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sema6cQ9WTM3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sema6cQ9WTM3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sema6cQ9WTM3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sema6cQ9WTM3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sema6cQ9WTM3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sema6cQ9WTM3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Sema6cQ9WTM3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Sema6cQ9WTM3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sema6cQ9WTM3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sema6cQ9WTM3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sema6cQ9WTM3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sema6cQ9WTM3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sema6cQ9WTM3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sema6cQ9WTM3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sema6cQ9WTM3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Sema6cQ9WTM3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sema6cQ9WTM3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sema6cQ9WTM3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sema6cQ9WTM3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sema6cQ9WTM3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sema6cQ9WTM3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sema6cQ9WTM3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sema6cQ9WTM3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sema6cQ9WTM3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sema6cQ9WTM3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sema6cQ9WTM3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sema6cQ9WTM3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sema6cQ9WTM3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sema6cQ9WTM3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sema6cQ9WTM3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sema6cQ9WTM3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sema6cQ9WTM3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sema6cQ9WTM3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sema6cQ9WTM3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sema6cQ9WTM3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sema6cQ9WTM3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sema6cQ9WTM3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sema6cQ9WTM3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sema6cQ9WTM3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sema6cQ9WTM3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sema6cQ9WTM3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sema6cQ9WTM3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sema6cQ9WTM3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sema6cQ9WTM3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sema6cQ9WTM3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sema6cQ9WTM3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sema6cQ9WTM3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sema6cQ9WTM3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sema6cQ9WTM3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sema6cQ9WTM3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sema6cQ9WTM3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sema6cQ9WTM3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sema6cQ9WTM3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sema6cQ9WTM3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sema6cQ9WTM3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sema6cQ9WTM3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sema6cQ9WTM3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Sema6cQ9WTM3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sema6cQ9WTM3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sema6cQ9WTM3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sema6cQ9WTM3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sema6cQ9WTM3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sema6cQ9WTM3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sema6cQ9WTM3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sema6cQ9WTM3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sema6cQ9WTM3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Sema6cQ9WTM3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sema6cQ9WTM3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sema6cQ9WTM3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms