Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTJ8

Fam50b, Protein FAM50B, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam50bQ9WTJ8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fam50bQ9WTJ8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fam50bQ9WTJ8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fam50bQ9WTJ8 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fam50bQ9WTJ8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fam50bQ9WTJ8 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fam50bQ9WTJ8 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Fam50bQ9WTJ8 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fam50bQ9WTJ8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fam50bQ9WTJ8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fam50bQ9WTJ8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fam50bQ9WTJ8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fam50bQ9WTJ8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fam50bQ9WTJ8 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Fam50bQ9WTJ8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fam50bQ9WTJ8 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fam50bQ9WTJ8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fam50bQ9WTJ8 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fam50bQ9WTJ8 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fam50bQ9WTJ8 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Fam50bQ9WTJ8 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fam50bQ9WTJ8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fam50bQ9WTJ8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fam50bQ9WTJ8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fam50bQ9WTJ8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fam50bQ9WTJ8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fam50bQ9WTJ8 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fam50bQ9WTJ8 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fam50bQ9WTJ8 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fam50bQ9WTJ8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fam50bQ9WTJ8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fam50bQ9WTJ8 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fam50bQ9WTJ8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fam50bQ9WTJ8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fam50bQ9WTJ8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fam50bQ9WTJ8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fam50bQ9WTJ8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fam50bQ9WTJ8 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fam50bQ9WTJ8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fam50bQ9WTJ8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fam50bQ9WTJ8 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fam50bQ9WTJ8 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fam50bQ9WTJ8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fam50bQ9WTJ8 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Fam50bQ9WTJ8 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fam50bQ9WTJ8 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fam50bQ9WTJ8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fam50bQ9WTJ8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fam50bQ9WTJ8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fam50bQ9WTJ8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fam50bQ9WTJ8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fam50bQ9WTJ8 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fam50bQ9WTJ8 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Fam50bQ9WTJ8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fam50bQ9WTJ8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fam50bQ9WTJ8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fam50bQ9WTJ8 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fam50bQ9WTJ8 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fam50bQ9WTJ8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fam50bQ9WTJ8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fam50bQ9WTJ8 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fam50bQ9WTJ8 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fam50bQ9WTJ8 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Fam50bQ9WTJ8 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fam50bQ9WTJ8 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fam50bQ9WTJ8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fam50bQ9WTJ8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fam50bQ9WTJ8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fam50bQ9WTJ8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fam50bQ9WTJ8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fam50bQ9WTJ8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fam50bQ9WTJ8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fam50bQ9WTJ8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Fam50bQ9WTJ8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fam50bQ9WTJ8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fam50bQ9WTJ8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fam50bQ9WTJ8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fam50bQ9WTJ8 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fam50bQ9WTJ8 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fam50bQ9WTJ8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fam50bQ9WTJ8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fam50bQ9WTJ8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fam50bQ9WTJ8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fam50bQ9WTJ8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fam50bQ9WTJ8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fam50bQ9WTJ8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fam50bQ9WTJ8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fam50bQ9WTJ8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Fam50bQ9WTJ8 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Fam50bQ9WTJ8 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fam50bQ9WTJ8 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fam50bQ9WTJ8 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fam50bQ9WTJ8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fam50bQ9WTJ8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fam50bQ9WTJ8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fam50bQ9WTJ8 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fam50bQ9WTJ8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fam50bQ9WTJ8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fam50bQ9WTJ8 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fam50bQ9WTJ8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms