Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TapbpQ9R233 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TapbpQ9R233 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TapbpQ9R233 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TapbpQ9R233 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TapbpQ9R233 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TapbpQ9R233 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TapbpQ9R233 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TapbpQ9R233 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TapbpQ9R233 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TapbpQ9R233 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TapbpQ9R233 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TapbpQ9R233 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TapbpQ9R233 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TapbpQ9R233 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TapbpQ9R233 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TapbpQ9R233 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TapbpQ9R233 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TapbpQ9R233 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TapbpQ9R233 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TapbpQ9R233 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TapbpQ9R233 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TapbpQ9R233 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TapbpQ9R233 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TapbpQ9R233 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TapbpQ9R233 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TapbpQ9R233 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TapbpQ9R233 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TapbpQ9R233 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TapbpQ9R233 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TapbpQ9R233 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TapbpQ9R233 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TapbpQ9R233 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TapbpQ9R233 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TapbpQ9R233 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TapbpQ9R233 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TapbpQ9R233 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TapbpQ9R233 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TapbpQ9R233 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TapbpQ9R233 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TapbpQ9R233 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TapbpQ9R233 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TapbpQ9R233 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TapbpQ9R233 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TapbpQ9R233 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TapbpQ9R233 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TapbpQ9R233 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TapbpQ9R233 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TapbpQ9R233 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TapbpQ9R233 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TapbpQ9R233 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TapbpQ9R233 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TapbpQ9R233 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TapbpQ9R233 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TapbpQ9R233 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TapbpQ9R233 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TapbpQ9R233 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TapbpQ9R233 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TapbpQ9R233 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TapbpQ9R233 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TapbpQ9R233 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TapbpQ9R233 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TapbpQ9R233 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TapbpQ9R233 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TapbpQ9R233 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TapbpQ9R233 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TapbpQ9R233 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TapbpQ9R233 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TapbpQ9R233 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TapbpQ9R233 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TapbpQ9R233 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TapbpQ9R233 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TapbpQ9R233 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TapbpQ9R233 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TapbpQ9R233 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TapbpQ9R233 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TapbpQ9R233 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TapbpQ9R233 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TapbpQ9R233 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TapbpQ9R233 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TapbpQ9R233 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TapbpQ9R233 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TapbpQ9R233 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TapbpQ9R233 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TapbpQ9R233 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TapbpQ9R233 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TapbpQ9R233 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TapbpQ9R233 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TapbpQ9R233 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TapbpQ9R233 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TapbpQ9R233 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TapbpQ9R233 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TapbpQ9R233 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TapbpQ9R233 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TapbpQ9R233 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TapbpQ9R233 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TapbpQ9R233 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TapbpQ9R233 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TapbpQ9R233 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TapbpQ9R233 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms