Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P4

Psma1, Proteasome subunit alpha type-1, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma1Q9R1P4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psma1Q9R1P4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psma1Q9R1P4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Psma1Q9R1P4 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psma1Q9R1P4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psma1Q9R1P4 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psma1Q9R1P4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psma1Q9R1P4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psma1Q9R1P4 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psma1Q9R1P4 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psma1Q9R1P4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psma1Q9R1P4 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psma1Q9R1P4 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psma1Q9R1P4 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psma1Q9R1P4 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psma1Q9R1P4 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psma1Q9R1P4 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psma1Q9R1P4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psma1Q9R1P4 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psma1Q9R1P4 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psma1Q9R1P4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psma1Q9R1P4 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psma1Q9R1P4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psma1Q9R1P4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psma1Q9R1P4 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psma1Q9R1P4 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psma1Q9R1P4 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psma1Q9R1P4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psma1Q9R1P4 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psma1Q9R1P4 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psma1Q9R1P4 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psma1Q9R1P4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psma1Q9R1P4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psma1Q9R1P4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psma1Q9R1P4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psma1Q9R1P4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psma1Q9R1P4 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psma1Q9R1P4 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psma1Q9R1P4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psma1Q9R1P4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psma1Q9R1P4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psma1Q9R1P4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psma1Q9R1P4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psma1Q9R1P4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psma1Q9R1P4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psma1Q9R1P4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psma1Q9R1P4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psma1Q9R1P4 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psma1Q9R1P4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psma1Q9R1P4 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psma1Q9R1P4 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Psma1Q9R1P4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psma1Q9R1P4 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psma1Q9R1P4 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psma1Q9R1P4 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psma1Q9R1P4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psma1Q9R1P4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psma1Q9R1P4 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Psma1Q9R1P4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psma1Q9R1P4 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psma1Q9R1P4 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psma1Q9R1P4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psma1Q9R1P4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psma1Q9R1P4 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psma1Q9R1P4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psma1Q9R1P4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psma1Q9R1P4 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psma1Q9R1P4 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psma1Q9R1P4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psma1Q9R1P4 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psma1Q9R1P4 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psma1Q9R1P4 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psma1Q9R1P4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psma1Q9R1P4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psma1Q9R1P4 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psma1Q9R1P4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psma1Q9R1P4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psma1Q9R1P4 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psma1Q9R1P4 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psma1Q9R1P4 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psma1Q9R1P4 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psma1Q9R1P4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psma1Q9R1P4 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psma1Q9R1P4 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psma1Q9R1P4 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psma1Q9R1P4 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psma1Q9R1P4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psma1Q9R1P4 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psma1Q9R1P4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psma1Q9R1P4 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psma1Q9R1P4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psma1Q9R1P4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psma1Q9R1P4 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psma1Q9R1P4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psma1Q9R1P4 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psma1Q9R1P4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psma1Q9R1P4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psma1Q9R1P4 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psma1Q9R1P4 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psma1Q9R1P4 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms