Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P1

Psmb3, Proteasome subunit beta type-3, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb3Q9R1P1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Psmb3Q9R1P1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psmb3Q9R1P1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Psmb3Q9R1P1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psmb3Q9R1P1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psmb3Q9R1P1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psmb3Q9R1P1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psmb3Q9R1P1 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Psmb3Q9R1P1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psmb3Q9R1P1 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psmb3Q9R1P1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psmb3Q9R1P1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psmb3Q9R1P1 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psmb3Q9R1P1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psmb3Q9R1P1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psmb3Q9R1P1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psmb3Q9R1P1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psmb3Q9R1P1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psmb3Q9R1P1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psmb3Q9R1P1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psmb3Q9R1P1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psmb3Q9R1P1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psmb3Q9R1P1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psmb3Q9R1P1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psmb3Q9R1P1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psmb3Q9R1P1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psmb3Q9R1P1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psmb3Q9R1P1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psmb3Q9R1P1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psmb3Q9R1P1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psmb3Q9R1P1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psmb3Q9R1P1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psmb3Q9R1P1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psmb3Q9R1P1 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psmb3Q9R1P1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psmb3Q9R1P1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psmb3Q9R1P1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psmb3Q9R1P1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psmb3Q9R1P1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psmb3Q9R1P1 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psmb3Q9R1P1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psmb3Q9R1P1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psmb3Q9R1P1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psmb3Q9R1P1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psmb3Q9R1P1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psmb3Q9R1P1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psmb3Q9R1P1 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psmb3Q9R1P1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psmb3Q9R1P1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psmb3Q9R1P1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psmb3Q9R1P1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Psmb3Q9R1P1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Psmb3Q9R1P1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Psmb3Q9R1P1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Psmb3Q9R1P1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Psmb3Q9R1P1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psmb3Q9R1P1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psmb3Q9R1P1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psmb3Q9R1P1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psmb3Q9R1P1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psmb3Q9R1P1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psmb3Q9R1P1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psmb3Q9R1P1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psmb3Q9R1P1 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psmb3Q9R1P1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psmb3Q9R1P1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psmb3Q9R1P1 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psmb3Q9R1P1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psmb3Q9R1P1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psmb3Q9R1P1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psmb3Q9R1P1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psmb3Q9R1P1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psmb3Q9R1P1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psmb3Q9R1P1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psmb3Q9R1P1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psmb3Q9R1P1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psmb3Q9R1P1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psmb3Q9R1P1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psmb3Q9R1P1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psmb3Q9R1P1 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psmb3Q9R1P1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psmb3Q9R1P1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psmb3Q9R1P1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psmb3Q9R1P1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psmb3Q9R1P1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Psmb3Q9R1P1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Psmb3Q9R1P1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Psmb3Q9R1P1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Psmb3Q9R1P1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Psmb3Q9R1P1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Psmb3Q9R1P1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Psmb3Q9R1P1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Psmb3Q9R1P1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Psmb3Q9R1P1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Psmb3Q9R1P1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Psmb3Q9R1P1 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psmb3Q9R1P1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Psmb3Q9R1P1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psmb3Q9R1P1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psmb3Q9R1P1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms