Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P0

Psma4, Proteasome subunit alpha type-4, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma4Q9R1P0 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psma4Q9R1P0 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psma4Q9R1P0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Psma4Q9R1P0 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psma4Q9R1P0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psma4Q9R1P0 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psma4Q9R1P0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psma4Q9R1P0 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psma4Q9R1P0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psma4Q9R1P0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psma4Q9R1P0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psma4Q9R1P0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psma4Q9R1P0 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psma4Q9R1P0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psma4Q9R1P0 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psma4Q9R1P0 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psma4Q9R1P0 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psma4Q9R1P0 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psma4Q9R1P0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psma4Q9R1P0 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psma4Q9R1P0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psma4Q9R1P0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psma4Q9R1P0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psma4Q9R1P0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psma4Q9R1P0 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psma4Q9R1P0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psma4Q9R1P0 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psma4Q9R1P0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psma4Q9R1P0 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psma4Q9R1P0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psma4Q9R1P0 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psma4Q9R1P0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psma4Q9R1P0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psma4Q9R1P0 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psma4Q9R1P0 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psma4Q9R1P0 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psma4Q9R1P0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psma4Q9R1P0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psma4Q9R1P0 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psma4Q9R1P0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psma4Q9R1P0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psma4Q9R1P0 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psma4Q9R1P0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psma4Q9R1P0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psma4Q9R1P0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psma4Q9R1P0 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Psma4Q9R1P0 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psma4Q9R1P0 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psma4Q9R1P0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psma4Q9R1P0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Psma4Q9R1P0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psma4Q9R1P0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psma4Q9R1P0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Psma4Q9R1P0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psma4Q9R1P0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psma4Q9R1P0 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psma4Q9R1P0 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psma4Q9R1P0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psma4Q9R1P0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psma4Q9R1P0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psma4Q9R1P0 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psma4Q9R1P0 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psma4Q9R1P0 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psma4Q9R1P0 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psma4Q9R1P0 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psma4Q9R1P0 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psma4Q9R1P0 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psma4Q9R1P0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psma4Q9R1P0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Psma4Q9R1P0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psma4Q9R1P0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psma4Q9R1P0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Psma4Q9R1P0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psma4Q9R1P0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Psma4Q9R1P0 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psma4Q9R1P0 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psma4Q9R1P0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psma4Q9R1P0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psma4Q9R1P0 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psma4Q9R1P0 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psma4Q9R1P0 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psma4Q9R1P0 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psma4Q9R1P0 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psma4Q9R1P0 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psma4Q9R1P0 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psma4Q9R1P0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psma4Q9R1P0 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psma4Q9R1P0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psma4Q9R1P0 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psma4Q9R1P0 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psma4Q9R1P0 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psma4Q9R1P0 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psma4Q9R1P0 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psma4Q9R1P0 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Psma4Q9R1P0 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psma4Q9R1P0 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psma4Q9R1P0 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psma4Q9R1P0 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psma4Q9R1P0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psma4Q9R1P0 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms