Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1I1

Chst4, Carbohydrate sulfotransferase 4, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chst4Q9R1I1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chst4Q9R1I1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chst4Q9R1I1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chst4Q9R1I1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Chst4Q9R1I1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chst4Q9R1I1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chst4Q9R1I1 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chst4Q9R1I1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chst4Q9R1I1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chst4Q9R1I1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chst4Q9R1I1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chst4Q9R1I1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chst4Q9R1I1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chst4Q9R1I1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chst4Q9R1I1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chst4Q9R1I1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chst4Q9R1I1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chst4Q9R1I1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chst4Q9R1I1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chst4Q9R1I1 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chst4Q9R1I1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chst4Q9R1I1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chst4Q9R1I1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chst4Q9R1I1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chst4Q9R1I1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chst4Q9R1I1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chst4Q9R1I1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chst4Q9R1I1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chst4Q9R1I1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chst4Q9R1I1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chst4Q9R1I1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chst4Q9R1I1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chst4Q9R1I1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chst4Q9R1I1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chst4Q9R1I1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chst4Q9R1I1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chst4Q9R1I1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chst4Q9R1I1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chst4Q9R1I1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chst4Q9R1I1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chst4Q9R1I1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chst4Q9R1I1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chst4Q9R1I1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chst4Q9R1I1 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chst4Q9R1I1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chst4Q9R1I1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chst4Q9R1I1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chst4Q9R1I1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chst4Q9R1I1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chst4Q9R1I1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chst4Q9R1I1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chst4Q9R1I1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chst4Q9R1I1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chst4Q9R1I1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Chst4Q9R1I1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Chst4Q9R1I1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chst4Q9R1I1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chst4Q9R1I1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chst4Q9R1I1 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chst4Q9R1I1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chst4Q9R1I1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Chst4Q9R1I1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Chst4Q9R1I1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Chst4Q9R1I1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Chst4Q9R1I1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chst4Q9R1I1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chst4Q9R1I1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chst4Q9R1I1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chst4Q9R1I1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chst4Q9R1I1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chst4Q9R1I1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chst4Q9R1I1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Chst4Q9R1I1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chst4Q9R1I1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chst4Q9R1I1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chst4Q9R1I1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chst4Q9R1I1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chst4Q9R1I1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chst4Q9R1I1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chst4Q9R1I1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chst4Q9R1I1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chst4Q9R1I1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chst4Q9R1I1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chst4Q9R1I1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chst4Q9R1I1 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chst4Q9R1I1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chst4Q9R1I1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chst4Q9R1I1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chst4Q9R1I1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chst4Q9R1I1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chst4Q9R1I1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chst4Q9R1I1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chst4Q9R1I1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chst4Q9R1I1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chst4Q9R1I1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chst4Q9R1I1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chst4Q9R1I1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Chst4Q9R1I1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Chst4Q9R1I1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Chst4Q9R1I1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms