Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G7

Zeb2, Zinc finger E-box-binding homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zeb2Q9R0G7 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Zeb2Q9R0G7 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Zeb2Q9R0G7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Zeb2Q9R0G7 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Zeb2Q9R0G7 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Zeb2Q9R0G7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Zeb2Q9R0G7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Zeb2Q9R0G7 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Zeb2Q9R0G7 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Zeb2Q9R0G7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Zeb2Q9R0G7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Zeb2Q9R0G7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Zeb2Q9R0G7 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Zeb2Q9R0G7 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Zeb2Q9R0G7 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Zeb2Q9R0G7 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Zeb2Q9R0G7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Zeb2Q9R0G7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Zeb2Q9R0G7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Zeb2Q9R0G7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Zeb2Q9R0G7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Zeb2Q9R0G7 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Zeb2Q9R0G7 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Zeb2Q9R0G7 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Zeb2Q9R0G7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Zeb2Q9R0G7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Zeb2Q9R0G7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Zeb2Q9R0G7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Zeb2Q9R0G7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Zeb2Q9R0G7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Zeb2Q9R0G7 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Zeb2Q9R0G7 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Zeb2Q9R0G7 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Zeb2Q9R0G7 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Zeb2Q9R0G7 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Zeb2Q9R0G7 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Zeb2Q9R0G7 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Zeb2Q9R0G7 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Zeb2Q9R0G7 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Zeb2Q9R0G7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Zeb2Q9R0G7 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Zeb2Q9R0G7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Zeb2Q9R0G7 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Zeb2Q9R0G7 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Zeb2Q9R0G7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Zeb2Q9R0G7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Zeb2Q9R0G7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Zeb2Q9R0G7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Zeb2Q9R0G7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Zeb2Q9R0G7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Zeb2Q9R0G7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Zeb2Q9R0G7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Zeb2Q9R0G7 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Zeb2Q9R0G7 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Zeb2Q9R0G7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Zeb2Q9R0G7 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Zeb2Q9R0G7 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Zeb2Q9R0G7 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Zeb2Q9R0G7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Zeb2Q9R0G7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Zeb2Q9R0G7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Zeb2Q9R0G7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Zeb2Q9R0G7 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Zeb2Q9R0G7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Zeb2Q9R0G7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Zeb2Q9R0G7 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Zeb2Q9R0G7 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Zeb2Q9R0G7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Zeb2Q9R0G7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Zeb2Q9R0G7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Zeb2Q9R0G7 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Zeb2Q9R0G7 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Zeb2Q9R0G7 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Zeb2Q9R0G7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Zeb2Q9R0G7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Zeb2Q9R0G7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Zeb2Q9R0G7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Zeb2Q9R0G7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Zeb2Q9R0G7 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Zeb2Q9R0G7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Zeb2Q9R0G7 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Zeb2Q9R0G7 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Zeb2Q9R0G7 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Zeb2Q9R0G7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Zeb2Q9R0G7 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Zeb2Q9R0G7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Zeb2Q9R0G7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Zeb2Q9R0G7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Zeb2Q9R0G7 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Zeb2Q9R0G7 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Zeb2Q9R0G7 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Zeb2Q9R0G7 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Zeb2Q9R0G7 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Zeb2Q9R0G7 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Zeb2Q9R0G7 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Zeb2Q9R0G7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Zeb2Q9R0G7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Zeb2Q9R0G7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Zeb2Q9R0G7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Zeb2Q9R0G7 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms