Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B9

Plod2, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod2Q9R0B9 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Plod2Q9R0B9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Plod2Q9R0B9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Plod2Q9R0B9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Plod2Q9R0B9 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Plod2Q9R0B9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Plod2Q9R0B9 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Plod2Q9R0B9 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Plod2Q9R0B9 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Plod2Q9R0B9 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Plod2Q9R0B9 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Plod2Q9R0B9 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Plod2Q9R0B9 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Plod2Q9R0B9 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Plod2Q9R0B9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Plod2Q9R0B9 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Plod2Q9R0B9 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Plod2Q9R0B9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Plod2Q9R0B9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Plod2Q9R0B9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Plod2Q9R0B9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Plod2Q9R0B9 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Plod2Q9R0B9 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Plod2Q9R0B9 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Plod2Q9R0B9 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Plod2Q9R0B9 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Plod2Q9R0B9 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Plod2Q9R0B9 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Plod2Q9R0B9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Plod2Q9R0B9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Plod2Q9R0B9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Plod2Q9R0B9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Plod2Q9R0B9 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Plod2Q9R0B9 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Plod2Q9R0B9 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Plod2Q9R0B9 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Plod2Q9R0B9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Plod2Q9R0B9 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Plod2Q9R0B9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Plod2Q9R0B9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Plod2Q9R0B9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Plod2Q9R0B9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Plod2Q9R0B9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Plod2Q9R0B9 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Plod2Q9R0B9 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Plod2Q9R0B9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Plod2Q9R0B9 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Plod2Q9R0B9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Plod2Q9R0B9 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Plod2Q9R0B9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Plod2Q9R0B9 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Plod2Q9R0B9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Plod2Q9R0B9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Plod2Q9R0B9 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Plod2Q9R0B9 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Plod2Q9R0B9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Plod2Q9R0B9 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Plod2Q9R0B9 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Plod2Q9R0B9 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Plod2Q9R0B9 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Plod2Q9R0B9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Plod2Q9R0B9 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Plod2Q9R0B9 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Plod2Q9R0B9 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Plod2Q9R0B9 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Plod2Q9R0B9 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Plod2Q9R0B9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Plod2Q9R0B9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Plod2Q9R0B9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Plod2Q9R0B9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Plod2Q9R0B9 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Plod2Q9R0B9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Plod2Q9R0B9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Plod2Q9R0B9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Plod2Q9R0B9 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Plod2Q9R0B9 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Plod2Q9R0B9 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Plod2Q9R0B9 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Plod2Q9R0B9 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Plod2Q9R0B9 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Plod2Q9R0B9 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Plod2Q9R0B9 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Plod2Q9R0B9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Plod2Q9R0B9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Plod2Q9R0B9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Plod2Q9R0B9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Plod2Q9R0B9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Plod2Q9R0B9 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Plod2Q9R0B9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Plod2Q9R0B9 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Plod2Q9R0B9 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Plod2Q9R0B9 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Plod2Q9R0B9 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Plod2Q9R0B9 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Plod2Q9R0B9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Plod2Q9R0B9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Plod2Q9R0B9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Plod2Q9R0B9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Plod2Q9R0B9 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Plod2Q9R0B9 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms