Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Lamc3Q9R0B6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Lamc3Q9R0B6 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
Lamc3Q9R0B6 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Lamc3Q9R0B6 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Lamc3Q9R0B6 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Lamc3Q9R0B6 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Lamc3Q9R0B6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
Lamc3Q9R0B6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Lamc3Q9R0B6 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Lamc3Q9R0B6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Lamc3Q9R0B6 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
Lamc3Q9R0B6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Lamc3Q9R0B6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
Lamc3Q9R0B6 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Lamc3Q9R0B6 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
Lamc3Q9R0B6 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
Lamc3Q9R0B6 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
Lamc3Q9R0B6 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
Lamc3Q9R0B6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Lamc3Q9R0B6 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC31.77■■■□□ 2.68
Lamc3Q9R0B6 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
Lamc3Q9R0B6 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
Lamc3Q9R0B6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.68
Lamc3Q9R0B6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.68
Lamc3Q9R0B6 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Lamc3Q9R0B6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Lamc3Q9R0B6 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
Lamc3Q9R0B6 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
Lamc3Q9R0B6 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Lamc3Q9R0B6 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Lamc3Q9R0B6 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Lamc3Q9R0B6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Lamc3Q9R0B6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Lamc3Q9R0B6 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Lamc3Q9R0B6 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Lamc3Q9R0B6 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
Lamc3Q9R0B6 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
Lamc3Q9R0B6 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Lamc3Q9R0B6 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Lamc3Q9R0B6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Lamc3Q9R0B6 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Lamc3Q9R0B6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Lamc3Q9R0B6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Lamc3Q9R0B6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Lamc3Q9R0B6 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Lamc3Q9R0B6 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Lamc3Q9R0B6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Lamc3Q9R0B6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Lamc3Q9R0B6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Lamc3Q9R0B6 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Lamc3Q9R0B6 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Lamc3Q9R0B6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Lamc3Q9R0B6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Lamc3Q9R0B6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Lamc3Q9R0B6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Lamc3Q9R0B6 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Lamc3Q9R0B6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Lamc3Q9R0B6 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
Lamc3Q9R0B6 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Lamc3Q9R0B6 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Lamc3Q9R0B6 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
Lamc3Q9R0B6 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Lamc3Q9R0B6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Lamc3Q9R0B6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
Lamc3Q9R0B6 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Lamc3Q9R0B6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Lamc3Q9R0B6 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Lamc3Q9R0B6 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Lamc3Q9R0B6 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Lamc3Q9R0B6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Lamc3Q9R0B6 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
Lamc3Q9R0B6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
Lamc3Q9R0B6 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Lamc3Q9R0B6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Lamc3Q9R0B6 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Lamc3Q9R0B6 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Lamc3Q9R0B6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Lamc3Q9R0B6 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Lamc3Q9R0B6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Lamc3Q9R0B6 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Lamc3Q9R0B6 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Lamc3Q9R0B6 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Lamc3Q9R0B6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Lamc3Q9R0B6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Lamc3Q9R0B6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Lamc3Q9R0B6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Lamc3Q9R0B6 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Lamc3Q9R0B6 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
Lamc3Q9R0B6 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Lamc3Q9R0B6 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Lamc3Q9R0B6 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Lamc3Q9R0B6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Lamc3Q9R0B6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Lamc3Q9R0B6 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Lamc3Q9R0B6 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Lamc3Q9R0B6 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Lamc3Q9R0B6 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Lamc3Q9R0B6 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Lamc3Q9R0B6 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.2 ms