Protein–RNA interactions for Protein: Q9R078

Prkab1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkab1Q9R078 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prkab1Q9R078 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prkab1Q9R078 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prkab1Q9R078 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prkab1Q9R078 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prkab1Q9R078 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prkab1Q9R078 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prkab1Q9R078 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prkab1Q9R078 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prkab1Q9R078 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prkab1Q9R078 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prkab1Q9R078 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prkab1Q9R078 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prkab1Q9R078 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prkab1Q9R078 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prkab1Q9R078 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prkab1Q9R078 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prkab1Q9R078 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prkab1Q9R078 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Prkab1Q9R078 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Prkab1Q9R078 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Prkab1Q9R078 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prkab1Q9R078 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prkab1Q9R078 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prkab1Q9R078 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Prkab1Q9R078 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prkab1Q9R078 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prkab1Q9R078 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prkab1Q9R078 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prkab1Q9R078 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prkab1Q9R078 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prkab1Q9R078 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prkab1Q9R078 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prkab1Q9R078 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prkab1Q9R078 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prkab1Q9R078 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Prkab1Q9R078 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prkab1Q9R078 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prkab1Q9R078 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prkab1Q9R078 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prkab1Q9R078 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prkab1Q9R078 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prkab1Q9R078 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prkab1Q9R078 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prkab1Q9R078 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prkab1Q9R078 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prkab1Q9R078 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prkab1Q9R078 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prkab1Q9R078 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prkab1Q9R078 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prkab1Q9R078 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Prkab1Q9R078 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Prkab1Q9R078 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prkab1Q9R078 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prkab1Q9R078 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prkab1Q9R078 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prkab1Q9R078 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prkab1Q9R078 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prkab1Q9R078 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prkab1Q9R078 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Prkab1Q9R078 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prkab1Q9R078 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prkab1Q9R078 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prkab1Q9R078 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prkab1Q9R078 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prkab1Q9R078 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prkab1Q9R078 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prkab1Q9R078 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prkab1Q9R078 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prkab1Q9R078 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prkab1Q9R078 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prkab1Q9R078 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prkab1Q9R078 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prkab1Q9R078 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prkab1Q9R078 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prkab1Q9R078 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Prkab1Q9R078 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prkab1Q9R078 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prkab1Q9R078 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prkab1Q9R078 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prkab1Q9R078 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prkab1Q9R078 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prkab1Q9R078 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prkab1Q9R078 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prkab1Q9R078 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prkab1Q9R078 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prkab1Q9R078 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prkab1Q9R078 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prkab1Q9R078 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prkab1Q9R078 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prkab1Q9R078 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prkab1Q9R078 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prkab1Q9R078 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prkab1Q9R078 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prkab1Q9R078 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prkab1Q9R078 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prkab1Q9R078 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prkab1Q9R078 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prkab1Q9R078 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prkab1Q9R078 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms