Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnfrsf10bQ9QZM4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnfrsf10bQ9QZM4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnfrsf10bQ9QZM4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnfrsf10bQ9QZM4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnfrsf10bQ9QZM4 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnfrsf10bQ9QZM4 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnfrsf10bQ9QZM4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnfrsf10bQ9QZM4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnfrsf10bQ9QZM4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnfrsf10bQ9QZM4 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnfrsf10bQ9QZM4 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnfrsf10bQ9QZM4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnfrsf10bQ9QZM4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnfrsf10bQ9QZM4 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnfrsf10bQ9QZM4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnfrsf10bQ9QZM4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnfrsf10bQ9QZM4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnfrsf10bQ9QZM4 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnfrsf10bQ9QZM4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnfrsf10bQ9QZM4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnfrsf10bQ9QZM4 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnfrsf10bQ9QZM4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnfrsf10bQ9QZM4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnfrsf10bQ9QZM4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnfrsf10bQ9QZM4 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tnfrsf10bQ9QZM4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tnfrsf10bQ9QZM4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tnfrsf10bQ9QZM4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tnfrsf10bQ9QZM4 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnfrsf10bQ9QZM4 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnfrsf10bQ9QZM4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnfrsf10bQ9QZM4 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnfrsf10bQ9QZM4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnfrsf10bQ9QZM4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnfrsf10bQ9QZM4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnfrsf10bQ9QZM4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnfrsf10bQ9QZM4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnfrsf10bQ9QZM4 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnfrsf10bQ9QZM4 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnfrsf10bQ9QZM4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnfrsf10bQ9QZM4 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnfrsf10bQ9QZM4 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnfrsf10bQ9QZM4 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnfrsf10bQ9QZM4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnfrsf10bQ9QZM4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnfrsf10bQ9QZM4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms