Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE5

Copg1, Coatomer subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg1Q9QZE5 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Copg1Q9QZE5 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Copg1Q9QZE5 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Copg1Q9QZE5 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Copg1Q9QZE5 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Copg1Q9QZE5 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Copg1Q9QZE5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Copg1Q9QZE5 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Copg1Q9QZE5 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Copg1Q9QZE5 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Copg1Q9QZE5 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Copg1Q9QZE5 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Copg1Q9QZE5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Copg1Q9QZE5 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Copg1Q9QZE5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Copg1Q9QZE5 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Copg1Q9QZE5 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Copg1Q9QZE5 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Copg1Q9QZE5 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Copg1Q9QZE5 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Copg1Q9QZE5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Copg1Q9QZE5 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Copg1Q9QZE5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Copg1Q9QZE5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Copg1Q9QZE5 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Copg1Q9QZE5 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Copg1Q9QZE5 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Copg1Q9QZE5 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Copg1Q9QZE5 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Copg1Q9QZE5 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Copg1Q9QZE5 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Copg1Q9QZE5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Copg1Q9QZE5 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Copg1Q9QZE5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Copg1Q9QZE5 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Copg1Q9QZE5 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Copg1Q9QZE5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Copg1Q9QZE5 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Copg1Q9QZE5 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Copg1Q9QZE5 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Copg1Q9QZE5 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Copg1Q9QZE5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Copg1Q9QZE5 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Copg1Q9QZE5 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Copg1Q9QZE5 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Copg1Q9QZE5 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Copg1Q9QZE5 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Copg1Q9QZE5 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Copg1Q9QZE5 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Copg1Q9QZE5 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Copg1Q9QZE5 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Copg1Q9QZE5 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Copg1Q9QZE5 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Copg1Q9QZE5 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Copg1Q9QZE5 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Copg1Q9QZE5 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Copg1Q9QZE5 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Copg1Q9QZE5 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Copg1Q9QZE5 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Copg1Q9QZE5 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Copg1Q9QZE5 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Copg1Q9QZE5 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Copg1Q9QZE5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Copg1Q9QZE5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Copg1Q9QZE5 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Copg1Q9QZE5 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Copg1Q9QZE5 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Copg1Q9QZE5 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Copg1Q9QZE5 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Copg1Q9QZE5 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Copg1Q9QZE5 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Copg1Q9QZE5 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Copg1Q9QZE5 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Copg1Q9QZE5 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Copg1Q9QZE5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Copg1Q9QZE5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Copg1Q9QZE5 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Copg1Q9QZE5 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Copg1Q9QZE5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Copg1Q9QZE5 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Copg1Q9QZE5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Copg1Q9QZE5 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Copg1Q9QZE5 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Copg1Q9QZE5 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Copg1Q9QZE5 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Copg1Q9QZE5 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Copg1Q9QZE5 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Copg1Q9QZE5 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Copg1Q9QZE5 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Copg1Q9QZE5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Copg1Q9QZE5 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Copg1Q9QZE5 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Copg1Q9QZE5 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Copg1Q9QZE5 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Copg1Q9QZE5 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Copg1Q9QZE5 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Copg1Q9QZE5 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Copg1Q9QZE5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Copg1Q9QZE5 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Copg1Q9QZE5 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms