Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rdh11Q9QYF1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rdh11Q9QYF1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rdh11Q9QYF1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rdh11Q9QYF1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rdh11Q9QYF1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rdh11Q9QYF1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rdh11Q9QYF1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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Rdh11Q9QYF1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rdh11Q9QYF1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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Rdh11Q9QYF1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rdh11Q9QYF1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rdh11Q9QYF1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rdh11Q9QYF1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
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Rdh11Q9QYF1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Rdh11Q9QYF1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Rdh11Q9QYF1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Rdh11Q9QYF1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Rdh11Q9QYF1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rdh11Q9QYF1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rdh11Q9QYF1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
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Rdh11Q9QYF1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rdh11Q9QYF1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rdh11Q9QYF1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rdh11Q9QYF1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rdh11Q9QYF1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rdh11Q9QYF1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rdh11Q9QYF1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rdh11Q9QYF1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rdh11Q9QYF1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rdh11Q9QYF1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rdh11Q9QYF1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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Rdh11Q9QYF1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Rdh11Q9QYF1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rdh11Q9QYF1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rdh11Q9QYF1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rdh11Q9QYF1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rdh11Q9QYF1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rdh11Q9QYF1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
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Rdh11Q9QYF1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rdh11Q9QYF1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rdh11Q9QYF1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rdh11Q9QYF1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rdh11Q9QYF1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rdh11Q9QYF1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rdh11Q9QYF1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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Rdh11Q9QYF1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rdh11Q9QYF1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rdh11Q9QYF1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rdh11Q9QYF1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rdh11Q9QYF1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rdh11Q9QYF1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
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Rdh11Q9QYF1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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Rdh11Q9QYF1 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rdh11Q9QYF1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rdh11Q9QYF1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rdh11Q9QYF1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rdh11Q9QYF1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Rdh11Q9QYF1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rdh11Q9QYF1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rdh11Q9QYF1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rdh11Q9QYF1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rdh11Q9QYF1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rdh11Q9QYF1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rdh11Q9QYF1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rdh11Q9QYF1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rdh11Q9QYF1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rdh11Q9QYF1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rdh11Q9QYF1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rdh11Q9QYF1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rdh11Q9QYF1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rdh11Q9QYF1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rdh11Q9QYF1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rdh11Q9QYF1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rdh11Q9QYF1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rdh11Q9QYF1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rdh11Q9QYF1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rdh11Q9QYF1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rdh11Q9QYF1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rdh11Q9QYF1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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