Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nphp1Q9QY53 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nphp1Q9QY53 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Nphp1Q9QY53 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Nphp1Q9QY53 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Nphp1Q9QY53 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nphp1Q9QY53 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Nphp1Q9QY53 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nphp1Q9QY53 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nphp1Q9QY53 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nphp1Q9QY53 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nphp1Q9QY53 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nphp1Q9QY53 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nphp1Q9QY53 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nphp1Q9QY53 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nphp1Q9QY53 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nphp1Q9QY53 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Nphp1Q9QY53 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Nphp1Q9QY53 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Nphp1Q9QY53 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nphp1Q9QY53 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nphp1Q9QY53 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nphp1Q9QY53 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nphp1Q9QY53 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nphp1Q9QY53 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nphp1Q9QY53 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nphp1Q9QY53 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nphp1Q9QY53 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nphp1Q9QY53 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nphp1Q9QY53 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nphp1Q9QY53 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nphp1Q9QY53 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Nphp1Q9QY53 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nphp1Q9QY53 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nphp1Q9QY53 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nphp1Q9QY53 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nphp1Q9QY53 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nphp1Q9QY53 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nphp1Q9QY53 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nphp1Q9QY53 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nphp1Q9QY53 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nphp1Q9QY53 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nphp1Q9QY53 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nphp1Q9QY53 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nphp1Q9QY53 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nphp1Q9QY53 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nphp1Q9QY53 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nphp1Q9QY53 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nphp1Q9QY53 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Nphp1Q9QY53 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nphp1Q9QY53 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Nphp1Q9QY53 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nphp1Q9QY53 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nphp1Q9QY53 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nphp1Q9QY53 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nphp1Q9QY53 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nphp1Q9QY53 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nphp1Q9QY53 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nphp1Q9QY53 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nphp1Q9QY53 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Nphp1Q9QY53 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nphp1Q9QY53 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nphp1Q9QY53 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Nphp1Q9QY53 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nphp1Q9QY53 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nphp1Q9QY53 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nphp1Q9QY53 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nphp1Q9QY53 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nphp1Q9QY53 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nphp1Q9QY53 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Nphp1Q9QY53 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nphp1Q9QY53 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nphp1Q9QY53 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nphp1Q9QY53 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nphp1Q9QY53 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nphp1Q9QY53 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nphp1Q9QY53 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nphp1Q9QY53 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nphp1Q9QY53 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nphp1Q9QY53 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nphp1Q9QY53 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nphp1Q9QY53 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nphp1Q9QY53 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nphp1Q9QY53 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nphp1Q9QY53 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nphp1Q9QY53 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Nphp1Q9QY53 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nphp1Q9QY53 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Nphp1Q9QY53 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nphp1Q9QY53 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nphp1Q9QY53 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nphp1Q9QY53 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nphp1Q9QY53 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nphp1Q9QY53 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nphp1Q9QY53 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nphp1Q9QY53 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nphp1Q9QY53 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nphp1Q9QY53 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nphp1Q9QY53 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Nphp1Q9QY53 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms