Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXY6

Ehd3, EH domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ehd3Q9QXY6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ehd3Q9QXY6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ehd3Q9QXY6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ehd3Q9QXY6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ehd3Q9QXY6 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ehd3Q9QXY6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ehd3Q9QXY6 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ehd3Q9QXY6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ehd3Q9QXY6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ehd3Q9QXY6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ehd3Q9QXY6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ehd3Q9QXY6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ehd3Q9QXY6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ehd3Q9QXY6 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ehd3Q9QXY6 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ehd3Q9QXY6 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ehd3Q9QXY6 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ehd3Q9QXY6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ehd3Q9QXY6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ehd3Q9QXY6 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ehd3Q9QXY6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ehd3Q9QXY6 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ehd3Q9QXY6 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ehd3Q9QXY6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ehd3Q9QXY6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ehd3Q9QXY6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ehd3Q9QXY6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ehd3Q9QXY6 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ehd3Q9QXY6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ehd3Q9QXY6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ehd3Q9QXY6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ehd3Q9QXY6 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ehd3Q9QXY6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ehd3Q9QXY6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ehd3Q9QXY6 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ehd3Q9QXY6 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ehd3Q9QXY6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ehd3Q9QXY6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ehd3Q9QXY6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ehd3Q9QXY6 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ehd3Q9QXY6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ehd3Q9QXY6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ehd3Q9QXY6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ehd3Q9QXY6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ehd3Q9QXY6 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ehd3Q9QXY6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ehd3Q9QXY6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ehd3Q9QXY6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ehd3Q9QXY6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ehd3Q9QXY6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ehd3Q9QXY6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ehd3Q9QXY6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ehd3Q9QXY6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ehd3Q9QXY6 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ehd3Q9QXY6 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ehd3Q9QXY6 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ehd3Q9QXY6 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ehd3Q9QXY6 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ehd3Q9QXY6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ehd3Q9QXY6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ehd3Q9QXY6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ehd3Q9QXY6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ehd3Q9QXY6 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ehd3Q9QXY6 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ehd3Q9QXY6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ehd3Q9QXY6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ehd3Q9QXY6 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ehd3Q9QXY6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ehd3Q9QXY6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ehd3Q9QXY6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ehd3Q9QXY6 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ehd3Q9QXY6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ehd3Q9QXY6 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ehd3Q9QXY6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ehd3Q9QXY6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ehd3Q9QXY6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ehd3Q9QXY6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ehd3Q9QXY6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ehd3Q9QXY6 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ehd3Q9QXY6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ehd3Q9QXY6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ehd3Q9QXY6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ehd3Q9QXY6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ehd3Q9QXY6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ehd3Q9QXY6 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ehd3Q9QXY6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ehd3Q9QXY6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ehd3Q9QXY6 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ehd3Q9QXY6 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ehd3Q9QXY6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ehd3Q9QXY6 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ehd3Q9QXY6 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ehd3Q9QXY6 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ehd3Q9QXY6 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ehd3Q9QXY6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ehd3Q9QXY6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ehd3Q9QXY6 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ehd3Q9QXY6 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ehd3Q9QXY6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ehd3Q9QXY6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms