Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Limd1Q9QXD8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Limd1Q9QXD8 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Limd1Q9QXD8 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Limd1Q9QXD8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Limd1Q9QXD8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Limd1Q9QXD8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Limd1Q9QXD8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Limd1Q9QXD8 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Limd1Q9QXD8 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Limd1Q9QXD8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Limd1Q9QXD8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Limd1Q9QXD8 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Limd1Q9QXD8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Limd1Q9QXD8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Limd1Q9QXD8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Limd1Q9QXD8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Limd1Q9QXD8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Limd1Q9QXD8 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Limd1Q9QXD8 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Limd1Q9QXD8 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Limd1Q9QXD8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Limd1Q9QXD8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Limd1Q9QXD8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Limd1Q9QXD8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Limd1Q9QXD8 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Limd1Q9QXD8 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Limd1Q9QXD8 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Limd1Q9QXD8 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Limd1Q9QXD8 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Limd1Q9QXD8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Limd1Q9QXD8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Limd1Q9QXD8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Limd1Q9QXD8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Limd1Q9QXD8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Limd1Q9QXD8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Limd1Q9QXD8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Limd1Q9QXD8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Limd1Q9QXD8 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Limd1Q9QXD8 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Limd1Q9QXD8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Limd1Q9QXD8 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Limd1Q9QXD8 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Limd1Q9QXD8 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Limd1Q9QXD8 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Limd1Q9QXD8 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Limd1Q9QXD8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Limd1Q9QXD8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Limd1Q9QXD8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Limd1Q9QXD8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Limd1Q9QXD8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Limd1Q9QXD8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Limd1Q9QXD8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Limd1Q9QXD8 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Limd1Q9QXD8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Limd1Q9QXD8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Limd1Q9QXD8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Limd1Q9QXD8 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Limd1Q9QXD8 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Limd1Q9QXD8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Limd1Q9QXD8 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Limd1Q9QXD8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Limd1Q9QXD8 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Limd1Q9QXD8 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Limd1Q9QXD8 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Limd1Q9QXD8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Limd1Q9QXD8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Limd1Q9QXD8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Limd1Q9QXD8 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Limd1Q9QXD8 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Limd1Q9QXD8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Limd1Q9QXD8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Limd1Q9QXD8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Limd1Q9QXD8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Limd1Q9QXD8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Limd1Q9QXD8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Limd1Q9QXD8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Limd1Q9QXD8 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Limd1Q9QXD8 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Limd1Q9QXD8 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Limd1Q9QXD8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Limd1Q9QXD8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Limd1Q9QXD8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Limd1Q9QXD8 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Limd1Q9QXD8 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Limd1Q9QXD8 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Limd1Q9QXD8 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Limd1Q9QXD8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Limd1Q9QXD8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Limd1Q9QXD8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Limd1Q9QXD8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Limd1Q9QXD8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Limd1Q9QXD8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Limd1Q9QXD8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Limd1Q9QXD8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Limd1Q9QXD8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Limd1Q9QXD8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Limd1Q9QXD8 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Limd1Q9QXD8 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Limd1Q9QXD8 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
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