Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim44Q9QXA7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim44Q9QXA7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim44Q9QXA7 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim44Q9QXA7 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim44Q9QXA7 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim44Q9QXA7 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim44Q9QXA7 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim44Q9QXA7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim44Q9QXA7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim44Q9QXA7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim44Q9QXA7 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim44Q9QXA7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim44Q9QXA7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim44Q9QXA7 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim44Q9QXA7 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim44Q9QXA7 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim44Q9QXA7 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim44Q9QXA7 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim44Q9QXA7 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim44Q9QXA7 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim44Q9QXA7 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim44Q9QXA7 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim44Q9QXA7 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim44Q9QXA7 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim44Q9QXA7 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim44Q9QXA7 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim44Q9QXA7 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim44Q9QXA7 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim44Q9QXA7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim44Q9QXA7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim44Q9QXA7 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim44Q9QXA7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim44Q9QXA7 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim44Q9QXA7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim44Q9QXA7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Trim44Q9QXA7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim44Q9QXA7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim44Q9QXA7 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim44Q9QXA7 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim44Q9QXA7 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim44Q9QXA7 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim44Q9QXA7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim44Q9QXA7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim44Q9QXA7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim44Q9QXA7 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim44Q9QXA7 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim44Q9QXA7 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim44Q9QXA7 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim44Q9QXA7 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim44Q9QXA7 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim44Q9QXA7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim44Q9QXA7 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim44Q9QXA7 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Trim44Q9QXA7 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim44Q9QXA7 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim44Q9QXA7 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Trim44Q9QXA7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Trim44Q9QXA7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Trim44Q9QXA7 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim44Q9QXA7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Trim44Q9QXA7 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim44Q9QXA7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim44Q9QXA7 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim44Q9QXA7 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim44Q9QXA7 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim44Q9QXA7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim44Q9QXA7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim44Q9QXA7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim44Q9QXA7 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim44Q9QXA7 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim44Q9QXA7 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim44Q9QXA7 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim44Q9QXA7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim44Q9QXA7 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim44Q9QXA7 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim44Q9QXA7 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim44Q9QXA7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim44Q9QXA7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim44Q9QXA7 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim44Q9QXA7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim44Q9QXA7 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim44Q9QXA7 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim44Q9QXA7 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim44Q9QXA7 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim44Q9QXA7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim44Q9QXA7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim44Q9QXA7 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim44Q9QXA7 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim44Q9QXA7 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim44Q9QXA7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim44Q9QXA7 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim44Q9QXA7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim44Q9QXA7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim44Q9QXA7 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim44Q9QXA7 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim44Q9QXA7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim44Q9QXA7 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim44Q9QXA7 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim44Q9QXA7 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms