Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA1

Cyhr1, Cysteine and histidine-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyhr1Q9QXA1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cyhr1Q9QXA1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cyhr1Q9QXA1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cyhr1Q9QXA1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cyhr1Q9QXA1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cyhr1Q9QXA1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cyhr1Q9QXA1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cyhr1Q9QXA1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cyhr1Q9QXA1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cyhr1Q9QXA1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cyhr1Q9QXA1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cyhr1Q9QXA1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cyhr1Q9QXA1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cyhr1Q9QXA1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cyhr1Q9QXA1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cyhr1Q9QXA1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cyhr1Q9QXA1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cyhr1Q9QXA1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cyhr1Q9QXA1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cyhr1Q9QXA1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cyhr1Q9QXA1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cyhr1Q9QXA1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Cyhr1Q9QXA1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cyhr1Q9QXA1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cyhr1Q9QXA1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cyhr1Q9QXA1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cyhr1Q9QXA1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cyhr1Q9QXA1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cyhr1Q9QXA1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cyhr1Q9QXA1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cyhr1Q9QXA1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cyhr1Q9QXA1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cyhr1Q9QXA1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cyhr1Q9QXA1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cyhr1Q9QXA1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cyhr1Q9QXA1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cyhr1Q9QXA1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cyhr1Q9QXA1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cyhr1Q9QXA1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cyhr1Q9QXA1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cyhr1Q9QXA1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cyhr1Q9QXA1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cyhr1Q9QXA1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cyhr1Q9QXA1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cyhr1Q9QXA1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cyhr1Q9QXA1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cyhr1Q9QXA1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cyhr1Q9QXA1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cyhr1Q9QXA1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cyhr1Q9QXA1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cyhr1Q9QXA1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cyhr1Q9QXA1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Cyhr1Q9QXA1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cyhr1Q9QXA1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cyhr1Q9QXA1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cyhr1Q9QXA1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cyhr1Q9QXA1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cyhr1Q9QXA1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cyhr1Q9QXA1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cyhr1Q9QXA1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cyhr1Q9QXA1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cyhr1Q9QXA1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cyhr1Q9QXA1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cyhr1Q9QXA1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cyhr1Q9QXA1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cyhr1Q9QXA1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cyhr1Q9QXA1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cyhr1Q9QXA1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cyhr1Q9QXA1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cyhr1Q9QXA1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cyhr1Q9QXA1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cyhr1Q9QXA1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Cyhr1Q9QXA1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cyhr1Q9QXA1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cyhr1Q9QXA1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cyhr1Q9QXA1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cyhr1Q9QXA1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cyhr1Q9QXA1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cyhr1Q9QXA1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cyhr1Q9QXA1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cyhr1Q9QXA1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cyhr1Q9QXA1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cyhr1Q9QXA1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cyhr1Q9QXA1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cyhr1Q9QXA1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Cyhr1Q9QXA1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cyhr1Q9QXA1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cyhr1Q9QXA1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cyhr1Q9QXA1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cyhr1Q9QXA1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cyhr1Q9QXA1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cyhr1Q9QXA1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cyhr1Q9QXA1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cyhr1Q9QXA1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cyhr1Q9QXA1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cyhr1Q9QXA1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cyhr1Q9QXA1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cyhr1Q9QXA1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cyhr1Q9QXA1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cyhr1Q9QXA1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms