Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX15

Clca3a1, Calcium-activated chloride channel regulator 3A-1, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3a1Q9QX15 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Clca3a1Q9QX15 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Clca3a1Q9QX15 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Clca3a1Q9QX15 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Clca3a1Q9QX15 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Clca3a1Q9QX15 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Clca3a1Q9QX15 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clca3a1Q9QX15 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clca3a1Q9QX15 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clca3a1Q9QX15 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clca3a1Q9QX15 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Clca3a1Q9QX15 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clca3a1Q9QX15 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clca3a1Q9QX15 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clca3a1Q9QX15 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clca3a1Q9QX15 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clca3a1Q9QX15 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clca3a1Q9QX15 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clca3a1Q9QX15 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clca3a1Q9QX15 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clca3a1Q9QX15 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Clca3a1Q9QX15 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Clca3a1Q9QX15 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clca3a1Q9QX15 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clca3a1Q9QX15 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Clca3a1Q9QX15 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Clca3a1Q9QX15 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clca3a1Q9QX15 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clca3a1Q9QX15 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clca3a1Q9QX15 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clca3a1Q9QX15 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clca3a1Q9QX15 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clca3a1Q9QX15 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clca3a1Q9QX15 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clca3a1Q9QX15 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clca3a1Q9QX15 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clca3a1Q9QX15 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clca3a1Q9QX15 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clca3a1Q9QX15 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clca3a1Q9QX15 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clca3a1Q9QX15 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clca3a1Q9QX15 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clca3a1Q9QX15 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clca3a1Q9QX15 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clca3a1Q9QX15 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clca3a1Q9QX15 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clca3a1Q9QX15 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clca3a1Q9QX15 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clca3a1Q9QX15 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clca3a1Q9QX15 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clca3a1Q9QX15 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clca3a1Q9QX15 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clca3a1Q9QX15 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clca3a1Q9QX15 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clca3a1Q9QX15 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clca3a1Q9QX15 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clca3a1Q9QX15 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clca3a1Q9QX15 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clca3a1Q9QX15 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clca3a1Q9QX15 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clca3a1Q9QX15 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clca3a1Q9QX15 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clca3a1Q9QX15 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clca3a1Q9QX15 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clca3a1Q9QX15 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clca3a1Q9QX15 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clca3a1Q9QX15 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Clca3a1Q9QX15 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clca3a1Q9QX15 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clca3a1Q9QX15 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clca3a1Q9QX15 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clca3a1Q9QX15 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clca3a1Q9QX15 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clca3a1Q9QX15 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clca3a1Q9QX15 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clca3a1Q9QX15 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clca3a1Q9QX15 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clca3a1Q9QX15 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Clca3a1Q9QX15 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Clca3a1Q9QX15 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Clca3a1Q9QX15 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clca3a1Q9QX15 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clca3a1Q9QX15 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clca3a1Q9QX15 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clca3a1Q9QX15 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clca3a1Q9QX15 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clca3a1Q9QX15 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Clca3a1Q9QX15 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clca3a1Q9QX15 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clca3a1Q9QX15 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clca3a1Q9QX15 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clca3a1Q9QX15 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clca3a1Q9QX15 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clca3a1Q9QX15 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Clca3a1Q9QX15 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Clca3a1Q9QX15 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clca3a1Q9QX15 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clca3a1Q9QX15 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clca3a1Q9QX15 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clca3a1Q9QX15 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms