Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cln8Q9QUK3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cln8Q9QUK3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cln8Q9QUK3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cln8Q9QUK3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cln8Q9QUK3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cln8Q9QUK3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cln8Q9QUK3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cln8Q9QUK3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cln8Q9QUK3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Cln8Q9QUK3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cln8Q9QUK3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cln8Q9QUK3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cln8Q9QUK3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cln8Q9QUK3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cln8Q9QUK3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cln8Q9QUK3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cln8Q9QUK3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cln8Q9QUK3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Cln8Q9QUK3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cln8Q9QUK3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cln8Q9QUK3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cln8Q9QUK3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cln8Q9QUK3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cln8Q9QUK3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cln8Q9QUK3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cln8Q9QUK3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cln8Q9QUK3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cln8Q9QUK3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cln8Q9QUK3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cln8Q9QUK3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cln8Q9QUK3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cln8Q9QUK3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cln8Q9QUK3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cln8Q9QUK3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cln8Q9QUK3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cln8Q9QUK3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cln8Q9QUK3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cln8Q9QUK3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cln8Q9QUK3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cln8Q9QUK3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cln8Q9QUK3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cln8Q9QUK3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cln8Q9QUK3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cln8Q9QUK3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cln8Q9QUK3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cln8Q9QUK3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cln8Q9QUK3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cln8Q9QUK3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cln8Q9QUK3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cln8Q9QUK3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cln8Q9QUK3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cln8Q9QUK3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Cln8Q9QUK3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cln8Q9QUK3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cln8Q9QUK3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cln8Q9QUK3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cln8Q9QUK3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cln8Q9QUK3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cln8Q9QUK3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Cln8Q9QUK3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cln8Q9QUK3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cln8Q9QUK3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cln8Q9QUK3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Cln8Q9QUK3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cln8Q9QUK3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cln8Q9QUK3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cln8Q9QUK3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cln8Q9QUK3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cln8Q9QUK3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cln8Q9QUK3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cln8Q9QUK3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cln8Q9QUK3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cln8Q9QUK3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cln8Q9QUK3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cln8Q9QUK3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cln8Q9QUK3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cln8Q9QUK3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cln8Q9QUK3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cln8Q9QUK3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cln8Q9QUK3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cln8Q9QUK3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cln8Q9QUK3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Cln8Q9QUK3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Cln8Q9QUK3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Cln8Q9QUK3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Cln8Q9QUK3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cln8Q9QUK3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cln8Q9QUK3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cln8Q9QUK3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cln8Q9QUK3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cln8Q9QUK3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cln8Q9QUK3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cln8Q9QUK3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cln8Q9QUK3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cln8Q9QUK3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cln8Q9QUK3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Cln8Q9QUK3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cln8Q9QUK3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cln8Q9QUK3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms