Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csnk1eQ9JMK2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csnk1eQ9JMK2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csnk1eQ9JMK2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csnk1eQ9JMK2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Csnk1eQ9JMK2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Csnk1eQ9JMK2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Csnk1eQ9JMK2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Csnk1eQ9JMK2 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Csnk1eQ9JMK2 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Csnk1eQ9JMK2 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Csnk1eQ9JMK2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Csnk1eQ9JMK2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Csnk1eQ9JMK2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Csnk1eQ9JMK2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Csnk1eQ9JMK2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Csnk1eQ9JMK2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Csnk1eQ9JMK2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Csnk1eQ9JMK2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Csnk1eQ9JMK2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Csnk1eQ9JMK2 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Csnk1eQ9JMK2 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Csnk1eQ9JMK2 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Csnk1eQ9JMK2 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Csnk1eQ9JMK2 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Csnk1eQ9JMK2 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Csnk1eQ9JMK2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Csnk1eQ9JMK2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Csnk1eQ9JMK2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Csnk1eQ9JMK2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Csnk1eQ9JMK2 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Csnk1eQ9JMK2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Csnk1eQ9JMK2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Csnk1eQ9JMK2 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Csnk1eQ9JMK2 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Csnk1eQ9JMK2 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Csnk1eQ9JMK2 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Csnk1eQ9JMK2 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Csnk1eQ9JMK2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Csnk1eQ9JMK2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Csnk1eQ9JMK2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Csnk1eQ9JMK2 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Csnk1eQ9JMK2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csnk1eQ9JMK2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csnk1eQ9JMK2 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Csnk1eQ9JMK2 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csnk1eQ9JMK2 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csnk1eQ9JMK2 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csnk1eQ9JMK2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csnk1eQ9JMK2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csnk1eQ9JMK2 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csnk1eQ9JMK2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csnk1eQ9JMK2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csnk1eQ9JMK2 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csnk1eQ9JMK2 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csnk1eQ9JMK2 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csnk1eQ9JMK2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csnk1eQ9JMK2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csnk1eQ9JMK2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csnk1eQ9JMK2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csnk1eQ9JMK2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csnk1eQ9JMK2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csnk1eQ9JMK2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csnk1eQ9JMK2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csnk1eQ9JMK2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csnk1eQ9JMK2 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csnk1eQ9JMK2 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Csnk1eQ9JMK2 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Csnk1eQ9JMK2 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csnk1eQ9JMK2 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csnk1eQ9JMK2 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csnk1eQ9JMK2 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csnk1eQ9JMK2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csnk1eQ9JMK2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csnk1eQ9JMK2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csnk1eQ9JMK2 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csnk1eQ9JMK2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csnk1eQ9JMK2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csnk1eQ9JMK2 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csnk1eQ9JMK2 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csnk1eQ9JMK2 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csnk1eQ9JMK2 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csnk1eQ9JMK2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csnk1eQ9JMK2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csnk1eQ9JMK2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csnk1eQ9JMK2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csnk1eQ9JMK2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csnk1eQ9JMK2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csnk1eQ9JMK2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csnk1eQ9JMK2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csnk1eQ9JMK2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csnk1eQ9JMK2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csnk1eQ9JMK2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csnk1eQ9JMK2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csnk1eQ9JMK2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csnk1eQ9JMK2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csnk1eQ9JMK2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csnk1eQ9JMK2 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csnk1eQ9JMK2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csnk1eQ9JMK2 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms