Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMJ2

Fbxw4, F-box/WD repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxw4Q9JMJ2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbxw4Q9JMJ2 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbxw4Q9JMJ2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbxw4Q9JMJ2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbxw4Q9JMJ2 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbxw4Q9JMJ2 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbxw4Q9JMJ2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbxw4Q9JMJ2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbxw4Q9JMJ2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbxw4Q9JMJ2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbxw4Q9JMJ2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbxw4Q9JMJ2 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbxw4Q9JMJ2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbxw4Q9JMJ2 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbxw4Q9JMJ2 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbxw4Q9JMJ2 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbxw4Q9JMJ2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbxw4Q9JMJ2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbxw4Q9JMJ2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbxw4Q9JMJ2 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbxw4Q9JMJ2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbxw4Q9JMJ2 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbxw4Q9JMJ2 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbxw4Q9JMJ2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbxw4Q9JMJ2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbxw4Q9JMJ2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbxw4Q9JMJ2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbxw4Q9JMJ2 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbxw4Q9JMJ2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbxw4Q9JMJ2 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbxw4Q9JMJ2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbxw4Q9JMJ2 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbxw4Q9JMJ2 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fbxw4Q9JMJ2 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fbxw4Q9JMJ2 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fbxw4Q9JMJ2 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fbxw4Q9JMJ2 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fbxw4Q9JMJ2 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fbxw4Q9JMJ2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fbxw4Q9JMJ2 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fbxw4Q9JMJ2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fbxw4Q9JMJ2 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fbxw4Q9JMJ2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fbxw4Q9JMJ2 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fbxw4Q9JMJ2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fbxw4Q9JMJ2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbxw4Q9JMJ2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbxw4Q9JMJ2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbxw4Q9JMJ2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbxw4Q9JMJ2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbxw4Q9JMJ2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbxw4Q9JMJ2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbxw4Q9JMJ2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbxw4Q9JMJ2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbxw4Q9JMJ2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbxw4Q9JMJ2 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxw4Q9JMJ2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxw4Q9JMJ2 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxw4Q9JMJ2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxw4Q9JMJ2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxw4Q9JMJ2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxw4Q9JMJ2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxw4Q9JMJ2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxw4Q9JMJ2 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxw4Q9JMJ2 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxw4Q9JMJ2 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxw4Q9JMJ2 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxw4Q9JMJ2 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxw4Q9JMJ2 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxw4Q9JMJ2 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxw4Q9JMJ2 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxw4Q9JMJ2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxw4Q9JMJ2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxw4Q9JMJ2 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxw4Q9JMJ2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxw4Q9JMJ2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxw4Q9JMJ2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxw4Q9JMJ2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxw4Q9JMJ2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxw4Q9JMJ2 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxw4Q9JMJ2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxw4Q9JMJ2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxw4Q9JMJ2 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxw4Q9JMJ2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxw4Q9JMJ2 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxw4Q9JMJ2 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxw4Q9JMJ2 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxw4Q9JMJ2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxw4Q9JMJ2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxw4Q9JMJ2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxw4Q9JMJ2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxw4Q9JMJ2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxw4Q9JMJ2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxw4Q9JMJ2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxw4Q9JMJ2 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxw4Q9JMJ2 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxw4Q9JMJ2 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxw4Q9JMJ2 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxw4Q9JMJ2 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxw4Q9JMJ2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms