Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG7

Hdgfl3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl3Q9JMG7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hdgfl3Q9JMG7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hdgfl3Q9JMG7 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hdgfl3Q9JMG7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hdgfl3Q9JMG7 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hdgfl3Q9JMG7 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hdgfl3Q9JMG7 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hdgfl3Q9JMG7 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hdgfl3Q9JMG7 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hdgfl3Q9JMG7 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hdgfl3Q9JMG7 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hdgfl3Q9JMG7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hdgfl3Q9JMG7 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hdgfl3Q9JMG7 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hdgfl3Q9JMG7 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hdgfl3Q9JMG7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hdgfl3Q9JMG7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hdgfl3Q9JMG7 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hdgfl3Q9JMG7 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hdgfl3Q9JMG7 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hdgfl3Q9JMG7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hdgfl3Q9JMG7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hdgfl3Q9JMG7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hdgfl3Q9JMG7 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hdgfl3Q9JMG7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hdgfl3Q9JMG7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hdgfl3Q9JMG7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hdgfl3Q9JMG7 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hdgfl3Q9JMG7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hdgfl3Q9JMG7 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hdgfl3Q9JMG7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hdgfl3Q9JMG7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hdgfl3Q9JMG7 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hdgfl3Q9JMG7 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdgfl3Q9JMG7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdgfl3Q9JMG7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdgfl3Q9JMG7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdgfl3Q9JMG7 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdgfl3Q9JMG7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdgfl3Q9JMG7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdgfl3Q9JMG7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdgfl3Q9JMG7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdgfl3Q9JMG7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdgfl3Q9JMG7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdgfl3Q9JMG7 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdgfl3Q9JMG7 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdgfl3Q9JMG7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdgfl3Q9JMG7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdgfl3Q9JMG7 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdgfl3Q9JMG7 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdgfl3Q9JMG7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdgfl3Q9JMG7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdgfl3Q9JMG7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdgfl3Q9JMG7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdgfl3Q9JMG7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdgfl3Q9JMG7 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdgfl3Q9JMG7 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdgfl3Q9JMG7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdgfl3Q9JMG7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdgfl3Q9JMG7 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdgfl3Q9JMG7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdgfl3Q9JMG7 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdgfl3Q9JMG7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdgfl3Q9JMG7 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdgfl3Q9JMG7 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdgfl3Q9JMG7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdgfl3Q9JMG7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdgfl3Q9JMG7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdgfl3Q9JMG7 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdgfl3Q9JMG7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdgfl3Q9JMG7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdgfl3Q9JMG7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdgfl3Q9JMG7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdgfl3Q9JMG7 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdgfl3Q9JMG7 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdgfl3Q9JMG7 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdgfl3Q9JMG7 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdgfl3Q9JMG7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdgfl3Q9JMG7 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdgfl3Q9JMG7 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdgfl3Q9JMG7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdgfl3Q9JMG7 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdgfl3Q9JMG7 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdgfl3Q9JMG7 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdgfl3Q9JMG7 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hdgfl3Q9JMG7 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hdgfl3Q9JMG7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hdgfl3Q9JMG7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hdgfl3Q9JMG7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hdgfl3Q9JMG7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hdgfl3Q9JMG7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hdgfl3Q9JMG7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hdgfl3Q9JMG7 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hdgfl3Q9JMG7 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hdgfl3Q9JMG7 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hdgfl3Q9JMG7 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hdgfl3Q9JMG7 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hdgfl3Q9JMG7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hdgfl3Q9JMG7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hdgfl3Q9JMG7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms