Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG3

Tmub1, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmub1Q9JMG3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmub1Q9JMG3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmub1Q9JMG3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmub1Q9JMG3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmub1Q9JMG3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmub1Q9JMG3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmub1Q9JMG3 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmub1Q9JMG3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmub1Q9JMG3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmub1Q9JMG3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmub1Q9JMG3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmub1Q9JMG3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmub1Q9JMG3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmub1Q9JMG3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmub1Q9JMG3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmub1Q9JMG3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmub1Q9JMG3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmub1Q9JMG3 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmub1Q9JMG3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmub1Q9JMG3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmub1Q9JMG3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmub1Q9JMG3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmub1Q9JMG3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmub1Q9JMG3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmub1Q9JMG3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmub1Q9JMG3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmub1Q9JMG3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmub1Q9JMG3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmub1Q9JMG3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmub1Q9JMG3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmub1Q9JMG3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmub1Q9JMG3 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmub1Q9JMG3 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmub1Q9JMG3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmub1Q9JMG3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmub1Q9JMG3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmub1Q9JMG3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmub1Q9JMG3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmub1Q9JMG3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmub1Q9JMG3 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmub1Q9JMG3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmub1Q9JMG3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmub1Q9JMG3 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmub1Q9JMG3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmub1Q9JMG3 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmub1Q9JMG3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmub1Q9JMG3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmub1Q9JMG3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmub1Q9JMG3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmub1Q9JMG3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmub1Q9JMG3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmub1Q9JMG3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmub1Q9JMG3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmub1Q9JMG3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmub1Q9JMG3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmub1Q9JMG3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmub1Q9JMG3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmub1Q9JMG3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmub1Q9JMG3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmub1Q9JMG3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmub1Q9JMG3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmub1Q9JMG3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmub1Q9JMG3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmub1Q9JMG3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmub1Q9JMG3 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmub1Q9JMG3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmub1Q9JMG3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmub1Q9JMG3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmub1Q9JMG3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmub1Q9JMG3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmub1Q9JMG3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmub1Q9JMG3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmub1Q9JMG3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmub1Q9JMG3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmub1Q9JMG3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmub1Q9JMG3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmub1Q9JMG3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmub1Q9JMG3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmub1Q9JMG3 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmub1Q9JMG3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmub1Q9JMG3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmub1Q9JMG3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmub1Q9JMG3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmub1Q9JMG3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmub1Q9JMG3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmub1Q9JMG3 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmub1Q9JMG3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmub1Q9JMG3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmub1Q9JMG3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmub1Q9JMG3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmub1Q9JMG3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmub1Q9JMG3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmub1Q9JMG3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmub1Q9JMG3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmub1Q9JMG3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmub1Q9JMG3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmub1Q9JMG3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmub1Q9JMG3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmub1Q9JMG3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmub1Q9JMG3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms