Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM99

Prg4, Proteoglycan 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg4Q9JM99 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prg4Q9JM99 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prg4Q9JM99 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prg4Q9JM99 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prg4Q9JM99 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Prg4Q9JM99 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prg4Q9JM99 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prg4Q9JM99 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prg4Q9JM99 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prg4Q9JM99 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prg4Q9JM99 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Prg4Q9JM99 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prg4Q9JM99 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prg4Q9JM99 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prg4Q9JM99 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prg4Q9JM99 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prg4Q9JM99 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prg4Q9JM99 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prg4Q9JM99 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prg4Q9JM99 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prg4Q9JM99 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prg4Q9JM99 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prg4Q9JM99 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prg4Q9JM99 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prg4Q9JM99 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prg4Q9JM99 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prg4Q9JM99 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prg4Q9JM99 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prg4Q9JM99 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prg4Q9JM99 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prg4Q9JM99 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prg4Q9JM99 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prg4Q9JM99 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prg4Q9JM99 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prg4Q9JM99 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prg4Q9JM99 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prg4Q9JM99 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prg4Q9JM99 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prg4Q9JM99 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prg4Q9JM99 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Prg4Q9JM99 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prg4Q9JM99 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prg4Q9JM99 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prg4Q9JM99 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Prg4Q9JM99 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Prg4Q9JM99 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prg4Q9JM99 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prg4Q9JM99 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prg4Q9JM99 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prg4Q9JM99 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prg4Q9JM99 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prg4Q9JM99 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prg4Q9JM99 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prg4Q9JM99 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prg4Q9JM99 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Prg4Q9JM99 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Prg4Q9JM99 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prg4Q9JM99 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prg4Q9JM99 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prg4Q9JM99 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Prg4Q9JM99 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prg4Q9JM99 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prg4Q9JM99 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prg4Q9JM99 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prg4Q9JM99 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prg4Q9JM99 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prg4Q9JM99 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prg4Q9JM99 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prg4Q9JM99 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prg4Q9JM99 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prg4Q9JM99 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prg4Q9JM99 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prg4Q9JM99 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prg4Q9JM99 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prg4Q9JM99 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prg4Q9JM99 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prg4Q9JM99 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Prg4Q9JM99 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prg4Q9JM99 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prg4Q9JM99 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prg4Q9JM99 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prg4Q9JM99 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prg4Q9JM99 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prg4Q9JM99 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prg4Q9JM99 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prg4Q9JM99 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prg4Q9JM99 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prg4Q9JM99 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prg4Q9JM99 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prg4Q9JM99 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Prg4Q9JM99 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prg4Q9JM99 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prg4Q9JM99 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prg4Q9JM99 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prg4Q9JM99 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prg4Q9JM99 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prg4Q9JM99 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prg4Q9JM99 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prg4Q9JM99 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prg4Q9JM99 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms