Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SrfQ9JM73 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SrfQ9JM73 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SrfQ9JM73 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SrfQ9JM73 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SrfQ9JM73 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SrfQ9JM73 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SrfQ9JM73 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SrfQ9JM73 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SrfQ9JM73 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SrfQ9JM73 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SrfQ9JM73 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SrfQ9JM73 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SrfQ9JM73 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SrfQ9JM73 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SrfQ9JM73 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SrfQ9JM73 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SrfQ9JM73 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SrfQ9JM73 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SrfQ9JM73 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SrfQ9JM73 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SrfQ9JM73 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SrfQ9JM73 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SrfQ9JM73 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SrfQ9JM73 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SrfQ9JM73 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SrfQ9JM73 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SrfQ9JM73 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SrfQ9JM73 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SrfQ9JM73 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SrfQ9JM73 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SrfQ9JM73 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SrfQ9JM73 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SrfQ9JM73 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SrfQ9JM73 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SrfQ9JM73 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SrfQ9JM73 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SrfQ9JM73 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SrfQ9JM73 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SrfQ9JM73 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SrfQ9JM73 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SrfQ9JM73 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SrfQ9JM73 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SrfQ9JM73 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SrfQ9JM73 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SrfQ9JM73 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SrfQ9JM73 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SrfQ9JM73 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SrfQ9JM73 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SrfQ9JM73 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SrfQ9JM73 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SrfQ9JM73 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
SrfQ9JM73 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SrfQ9JM73 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SrfQ9JM73 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SrfQ9JM73 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SrfQ9JM73 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SrfQ9JM73 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SrfQ9JM73 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SrfQ9JM73 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SrfQ9JM73 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SrfQ9JM73 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SrfQ9JM73 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SrfQ9JM73 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SrfQ9JM73 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SrfQ9JM73 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SrfQ9JM73 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SrfQ9JM73 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SrfQ9JM73 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SrfQ9JM73 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SrfQ9JM73 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SrfQ9JM73 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SrfQ9JM73 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SrfQ9JM73 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SrfQ9JM73 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SrfQ9JM73 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SrfQ9JM73 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SrfQ9JM73 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SrfQ9JM73 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SrfQ9JM73 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SrfQ9JM73 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SrfQ9JM73 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SrfQ9JM73 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SrfQ9JM73 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SrfQ9JM73 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SrfQ9JM73 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SrfQ9JM73 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SrfQ9JM73 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SrfQ9JM73 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SrfQ9JM73 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SrfQ9JM73 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SrfQ9JM73 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SrfQ9JM73 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SrfQ9JM73 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SrfQ9JM73 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SrfQ9JM73 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SrfQ9JM73 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SrfQ9JM73 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SrfQ9JM73 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SrfQ9JM73 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms