Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC6

Tef, Thyrotroph embryonic factor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefQ9JLC6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TefQ9JLC6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TefQ9JLC6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TefQ9JLC6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TefQ9JLC6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TefQ9JLC6 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TefQ9JLC6 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TefQ9JLC6 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TefQ9JLC6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TefQ9JLC6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TefQ9JLC6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TefQ9JLC6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TefQ9JLC6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TefQ9JLC6 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TefQ9JLC6 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TefQ9JLC6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TefQ9JLC6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TefQ9JLC6 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TefQ9JLC6 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TefQ9JLC6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TefQ9JLC6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TefQ9JLC6 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TefQ9JLC6 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TefQ9JLC6 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TefQ9JLC6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TefQ9JLC6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TefQ9JLC6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TefQ9JLC6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TefQ9JLC6 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TefQ9JLC6 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TefQ9JLC6 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TefQ9JLC6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TefQ9JLC6 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TefQ9JLC6 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TefQ9JLC6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TefQ9JLC6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TefQ9JLC6 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TefQ9JLC6 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TefQ9JLC6 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TefQ9JLC6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TefQ9JLC6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TefQ9JLC6 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TefQ9JLC6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TefQ9JLC6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TefQ9JLC6 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TefQ9JLC6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TefQ9JLC6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TefQ9JLC6 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TefQ9JLC6 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TefQ9JLC6 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TefQ9JLC6 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TefQ9JLC6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TefQ9JLC6 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TefQ9JLC6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TefQ9JLC6 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TefQ9JLC6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TefQ9JLC6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TefQ9JLC6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TefQ9JLC6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TefQ9JLC6 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TefQ9JLC6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TefQ9JLC6 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TefQ9JLC6 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TefQ9JLC6 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TefQ9JLC6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TefQ9JLC6 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TefQ9JLC6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TefQ9JLC6 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TefQ9JLC6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TefQ9JLC6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TefQ9JLC6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TefQ9JLC6 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TefQ9JLC6 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TefQ9JLC6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TefQ9JLC6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TefQ9JLC6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TefQ9JLC6 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TefQ9JLC6 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TefQ9JLC6 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TefQ9JLC6 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TefQ9JLC6 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TefQ9JLC6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TefQ9JLC6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TefQ9JLC6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TefQ9JLC6 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TefQ9JLC6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TefQ9JLC6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TefQ9JLC6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TefQ9JLC6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TefQ9JLC6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TefQ9JLC6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TefQ9JLC6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TefQ9JLC6 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TefQ9JLC6 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TefQ9JLC6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TefQ9JLC6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TefQ9JLC6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TefQ9JLC6 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TefQ9JLC6 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TefQ9JLC6 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms