Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY5

Hip1r, Huntingtin-interacting protein 1-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hip1rQ9JKY5 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hip1rQ9JKY5 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hip1rQ9JKY5 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hip1rQ9JKY5 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hip1rQ9JKY5 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hip1rQ9JKY5 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hip1rQ9JKY5 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hip1rQ9JKY5 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hip1rQ9JKY5 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hip1rQ9JKY5 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hip1rQ9JKY5 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hip1rQ9JKY5 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hip1rQ9JKY5 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hip1rQ9JKY5 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hip1rQ9JKY5 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hip1rQ9JKY5 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hip1rQ9JKY5 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hip1rQ9JKY5 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hip1rQ9JKY5 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hip1rQ9JKY5 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hip1rQ9JKY5 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hip1rQ9JKY5 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hip1rQ9JKY5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hip1rQ9JKY5 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hip1rQ9JKY5 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Hip1rQ9JKY5 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Hip1rQ9JKY5 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hip1rQ9JKY5 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hip1rQ9JKY5 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Hip1rQ9JKY5 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hip1rQ9JKY5 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hip1rQ9JKY5 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hip1rQ9JKY5 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hip1rQ9JKY5 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hip1rQ9JKY5 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hip1rQ9JKY5 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hip1rQ9JKY5 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hip1rQ9JKY5 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hip1rQ9JKY5 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hip1rQ9JKY5 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hip1rQ9JKY5 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hip1rQ9JKY5 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hip1rQ9JKY5 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hip1rQ9JKY5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hip1rQ9JKY5 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hip1rQ9JKY5 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hip1rQ9JKY5 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hip1rQ9JKY5 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hip1rQ9JKY5 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hip1rQ9JKY5 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hip1rQ9JKY5 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hip1rQ9JKY5 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hip1rQ9JKY5 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hip1rQ9JKY5 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hip1rQ9JKY5 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hip1rQ9JKY5 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hip1rQ9JKY5 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Hip1rQ9JKY5 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Hip1rQ9JKY5 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Hip1rQ9JKY5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hip1rQ9JKY5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Hip1rQ9JKY5 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hip1rQ9JKY5 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hip1rQ9JKY5 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hip1rQ9JKY5 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hip1rQ9JKY5 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hip1rQ9JKY5 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Hip1rQ9JKY5 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hip1rQ9JKY5 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hip1rQ9JKY5 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hip1rQ9JKY5 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hip1rQ9JKY5 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hip1rQ9JKY5 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Hip1rQ9JKY5 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hip1rQ9JKY5 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hip1rQ9JKY5 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hip1rQ9JKY5 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Hip1rQ9JKY5 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hip1rQ9JKY5 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hip1rQ9JKY5 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hip1rQ9JKY5 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hip1rQ9JKY5 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hip1rQ9JKY5 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Hip1rQ9JKY5 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hip1rQ9JKY5 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hip1rQ9JKY5 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hip1rQ9JKY5 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Hip1rQ9JKY5 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hip1rQ9JKY5 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hip1rQ9JKY5 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hip1rQ9JKY5 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hip1rQ9JKY5 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hip1rQ9JKY5 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hip1rQ9JKY5 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hip1rQ9JKY5 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hip1rQ9JKY5 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hip1rQ9JKY5 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hip1rQ9JKY5 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hip1rQ9JKY5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hip1rQ9JKY5 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms