Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyp39a1Q9JKJ9 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyp39a1Q9JKJ9 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyp39a1Q9JKJ9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyp39a1Q9JKJ9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyp39a1Q9JKJ9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyp39a1Q9JKJ9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyp39a1Q9JKJ9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyp39a1Q9JKJ9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyp39a1Q9JKJ9 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyp39a1Q9JKJ9 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyp39a1Q9JKJ9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyp39a1Q9JKJ9 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cyp39a1Q9JKJ9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cyp39a1Q9JKJ9 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cyp39a1Q9JKJ9 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cyp39a1Q9JKJ9 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp39a1Q9JKJ9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp39a1Q9JKJ9 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp39a1Q9JKJ9 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp39a1Q9JKJ9 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp39a1Q9JKJ9 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp39a1Q9JKJ9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp39a1Q9JKJ9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp39a1Q9JKJ9 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp39a1Q9JKJ9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp39a1Q9JKJ9 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp39a1Q9JKJ9 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp39a1Q9JKJ9 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp39a1Q9JKJ9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp39a1Q9JKJ9 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp39a1Q9JKJ9 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp39a1Q9JKJ9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp39a1Q9JKJ9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp39a1Q9JKJ9 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp39a1Q9JKJ9 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp39a1Q9JKJ9 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp39a1Q9JKJ9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp39a1Q9JKJ9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp39a1Q9JKJ9 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp39a1Q9JKJ9 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp39a1Q9JKJ9 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp39a1Q9JKJ9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp39a1Q9JKJ9 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp39a1Q9JKJ9 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp39a1Q9JKJ9 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp39a1Q9JKJ9 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp39a1Q9JKJ9 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp39a1Q9JKJ9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyp39a1Q9JKJ9 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyp39a1Q9JKJ9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyp39a1Q9JKJ9 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyp39a1Q9JKJ9 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyp39a1Q9JKJ9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyp39a1Q9JKJ9 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyp39a1Q9JKJ9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyp39a1Q9JKJ9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyp39a1Q9JKJ9 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp39a1Q9JKJ9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp39a1Q9JKJ9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp39a1Q9JKJ9 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp39a1Q9JKJ9 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp39a1Q9JKJ9 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp39a1Q9JKJ9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp39a1Q9JKJ9 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyp39a1Q9JKJ9 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyp39a1Q9JKJ9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyp39a1Q9JKJ9 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyp39a1Q9JKJ9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyp39a1Q9JKJ9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyp39a1Q9JKJ9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyp39a1Q9JKJ9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyp39a1Q9JKJ9 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyp39a1Q9JKJ9 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyp39a1Q9JKJ9 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyp39a1Q9JKJ9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyp39a1Q9JKJ9 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Cyp39a1Q9JKJ9 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cyp39a1Q9JKJ9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Cyp39a1Q9JKJ9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cyp39a1Q9JKJ9 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms