Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trem1Q9JKE2 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trem1Q9JKE2 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Trem1Q9JKE2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Trem1Q9JKE2 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trem1Q9JKE2 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trem1Q9JKE2 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trem1Q9JKE2 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trem1Q9JKE2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trem1Q9JKE2 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trem1Q9JKE2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Trem1Q9JKE2 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trem1Q9JKE2 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trem1Q9JKE2 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trem1Q9JKE2 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trem1Q9JKE2 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trem1Q9JKE2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trem1Q9JKE2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trem1Q9JKE2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trem1Q9JKE2 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trem1Q9JKE2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trem1Q9JKE2 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trem1Q9JKE2 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trem1Q9JKE2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trem1Q9JKE2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trem1Q9JKE2 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trem1Q9JKE2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trem1Q9JKE2 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trem1Q9JKE2 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trem1Q9JKE2 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trem1Q9JKE2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trem1Q9JKE2 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trem1Q9JKE2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trem1Q9JKE2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trem1Q9JKE2 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trem1Q9JKE2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trem1Q9JKE2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trem1Q9JKE2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trem1Q9JKE2 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trem1Q9JKE2 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trem1Q9JKE2 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trem1Q9JKE2 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trem1Q9JKE2 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trem1Q9JKE2 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trem1Q9JKE2 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trem1Q9JKE2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trem1Q9JKE2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trem1Q9JKE2 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trem1Q9JKE2 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trem1Q9JKE2 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trem1Q9JKE2 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trem1Q9JKE2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trem1Q9JKE2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trem1Q9JKE2 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trem1Q9JKE2 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trem1Q9JKE2 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trem1Q9JKE2 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trem1Q9JKE2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trem1Q9JKE2 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trem1Q9JKE2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trem1Q9JKE2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trem1Q9JKE2 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trem1Q9JKE2 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trem1Q9JKE2 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Trem1Q9JKE2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trem1Q9JKE2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trem1Q9JKE2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trem1Q9JKE2 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trem1Q9JKE2 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trem1Q9JKE2 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trem1Q9JKE2 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trem1Q9JKE2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trem1Q9JKE2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trem1Q9JKE2 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trem1Q9JKE2 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trem1Q9JKE2 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trem1Q9JKE2 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trem1Q9JKE2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Trem1Q9JKE2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trem1Q9JKE2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trem1Q9JKE2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trem1Q9JKE2 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trem1Q9JKE2 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trem1Q9JKE2 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trem1Q9JKE2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trem1Q9JKE2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trem1Q9JKE2 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trem1Q9JKE2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trem1Q9JKE2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trem1Q9JKE2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trem1Q9JKE2 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trem1Q9JKE2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trem1Q9JKE2 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trem1Q9JKE2 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trem1Q9JKE2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trem1Q9JKE2 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trem1Q9JKE2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trem1Q9JKE2 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trem1Q9JKE2 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trem1Q9JKE2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms