Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE1

Trem3, TREM-3, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem3Q9JKE1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trem3Q9JKE1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trem3Q9JKE1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trem3Q9JKE1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trem3Q9JKE1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trem3Q9JKE1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trem3Q9JKE1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trem3Q9JKE1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trem3Q9JKE1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trem3Q9JKE1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trem3Q9JKE1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trem3Q9JKE1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trem3Q9JKE1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trem3Q9JKE1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trem3Q9JKE1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trem3Q9JKE1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trem3Q9JKE1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trem3Q9JKE1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trem3Q9JKE1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trem3Q9JKE1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trem3Q9JKE1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trem3Q9JKE1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trem3Q9JKE1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trem3Q9JKE1 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trem3Q9JKE1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trem3Q9JKE1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trem3Q9JKE1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trem3Q9JKE1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trem3Q9JKE1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trem3Q9JKE1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trem3Q9JKE1 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trem3Q9JKE1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trem3Q9JKE1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trem3Q9JKE1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trem3Q9JKE1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trem3Q9JKE1 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trem3Q9JKE1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trem3Q9JKE1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trem3Q9JKE1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trem3Q9JKE1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trem3Q9JKE1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trem3Q9JKE1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trem3Q9JKE1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trem3Q9JKE1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trem3Q9JKE1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trem3Q9JKE1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trem3Q9JKE1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trem3Q9JKE1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trem3Q9JKE1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trem3Q9JKE1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trem3Q9JKE1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trem3Q9JKE1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trem3Q9JKE1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trem3Q9JKE1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trem3Q9JKE1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trem3Q9JKE1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trem3Q9JKE1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trem3Q9JKE1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trem3Q9JKE1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trem3Q9JKE1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trem3Q9JKE1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Trem3Q9JKE1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trem3Q9JKE1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trem3Q9JKE1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trem3Q9JKE1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trem3Q9JKE1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trem3Q9JKE1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trem3Q9JKE1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trem3Q9JKE1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trem3Q9JKE1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trem3Q9JKE1 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trem3Q9JKE1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trem3Q9JKE1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trem3Q9JKE1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trem3Q9JKE1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trem3Q9JKE1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trem3Q9JKE1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trem3Q9JKE1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trem3Q9JKE1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trem3Q9JKE1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trem3Q9JKE1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trem3Q9JKE1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trem3Q9JKE1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trem3Q9JKE1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trem3Q9JKE1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trem3Q9JKE1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trem3Q9JKE1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trem3Q9JKE1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trem3Q9JKE1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trem3Q9JKE1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trem3Q9JKE1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trem3Q9JKE1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trem3Q9JKE1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trem3Q9JKE1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trem3Q9JKE1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trem3Q9JKE1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trem3Q9JKE1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trem3Q9JKE1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trem3Q9JKE1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trem3Q9JKE1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms