Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Scamp5Q9JKD3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Scamp5Q9JKD3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Scamp5Q9JKD3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Scamp5Q9JKD3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Scamp5Q9JKD3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Scamp5Q9JKD3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Scamp5Q9JKD3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Scamp5Q9JKD3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Scamp5Q9JKD3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Scamp5Q9JKD3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Scamp5Q9JKD3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Scamp5Q9JKD3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Scamp5Q9JKD3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Scamp5Q9JKD3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Scamp5Q9JKD3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Scamp5Q9JKD3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Scamp5Q9JKD3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Scamp5Q9JKD3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Scamp5Q9JKD3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Scamp5Q9JKD3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Scamp5Q9JKD3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Scamp5Q9JKD3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Scamp5Q9JKD3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Scamp5Q9JKD3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Scamp5Q9JKD3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Scamp5Q9JKD3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Scamp5Q9JKD3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Scamp5Q9JKD3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Scamp5Q9JKD3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Scamp5Q9JKD3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Scamp5Q9JKD3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Scamp5Q9JKD3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Scamp5Q9JKD3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Scamp5Q9JKD3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Scamp5Q9JKD3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Scamp5Q9JKD3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Scamp5Q9JKD3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Scamp5Q9JKD3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Scamp5Q9JKD3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Scamp5Q9JKD3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Scamp5Q9JKD3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Scamp5Q9JKD3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Scamp5Q9JKD3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Scamp5Q9JKD3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Scamp5Q9JKD3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Scamp5Q9JKD3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Scamp5Q9JKD3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Scamp5Q9JKD3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Scamp5Q9JKD3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Scamp5Q9JKD3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Scamp5Q9JKD3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Scamp5Q9JKD3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Scamp5Q9JKD3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Scamp5Q9JKD3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Scamp5Q9JKD3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Scamp5Q9JKD3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Scamp5Q9JKD3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Scamp5Q9JKD3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Scamp5Q9JKD3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Scamp5Q9JKD3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Scamp5Q9JKD3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Scamp5Q9JKD3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Scamp5Q9JKD3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Scamp5Q9JKD3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Scamp5Q9JKD3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Scamp5Q9JKD3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Scamp5Q9JKD3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Scamp5Q9JKD3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Scamp5Q9JKD3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Scamp5Q9JKD3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Scamp5Q9JKD3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Scamp5Q9JKD3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Scamp5Q9JKD3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Scamp5Q9JKD3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Scamp5Q9JKD3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Scamp5Q9JKD3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Scamp5Q9JKD3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Scamp5Q9JKD3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Scamp5Q9JKD3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Scamp5Q9JKD3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Scamp5Q9JKD3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Scamp5Q9JKD3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Scamp5Q9JKD3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Scamp5Q9JKD3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Scamp5Q9JKD3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Scamp5Q9JKD3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Scamp5Q9JKD3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Scamp5Q9JKD3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Scamp5Q9JKD3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Scamp5Q9JKD3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Scamp5Q9JKD3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Scamp5Q9JKD3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Scamp5Q9JKD3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Scamp5Q9JKD3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Scamp5Q9JKD3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Scamp5Q9JKD3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Scamp5Q9JKD3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Scamp5Q9JKD3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Scamp5Q9JKD3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.7 ms