Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Uchl3Q9JKB1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Uchl3Q9JKB1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Uchl3Q9JKB1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Uchl3Q9JKB1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Uchl3Q9JKB1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Uchl3Q9JKB1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Uchl3Q9JKB1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Uchl3Q9JKB1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Uchl3Q9JKB1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Uchl3Q9JKB1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Uchl3Q9JKB1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Uchl3Q9JKB1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Uchl3Q9JKB1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Uchl3Q9JKB1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Uchl3Q9JKB1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Uchl3Q9JKB1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Uchl3Q9JKB1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Uchl3Q9JKB1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Uchl3Q9JKB1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Uchl3Q9JKB1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Uchl3Q9JKB1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Uchl3Q9JKB1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Uchl3Q9JKB1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Uchl3Q9JKB1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Uchl3Q9JKB1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Uchl3Q9JKB1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Uchl3Q9JKB1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Uchl3Q9JKB1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Uchl3Q9JKB1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Uchl3Q9JKB1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Uchl3Q9JKB1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Uchl3Q9JKB1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Uchl3Q9JKB1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Uchl3Q9JKB1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Uchl3Q9JKB1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Uchl3Q9JKB1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Uchl3Q9JKB1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Uchl3Q9JKB1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Uchl3Q9JKB1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Uchl3Q9JKB1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Uchl3Q9JKB1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Uchl3Q9JKB1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Uchl3Q9JKB1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Uchl3Q9JKB1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Uchl3Q9JKB1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Uchl3Q9JKB1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Uchl3Q9JKB1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Uchl3Q9JKB1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Uchl3Q9JKB1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Uchl3Q9JKB1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Uchl3Q9JKB1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Uchl3Q9JKB1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Uchl3Q9JKB1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Uchl3Q9JKB1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Uchl3Q9JKB1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Uchl3Q9JKB1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Uchl3Q9JKB1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Uchl3Q9JKB1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Uchl3Q9JKB1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Uchl3Q9JKB1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Uchl3Q9JKB1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Uchl3Q9JKB1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Uchl3Q9JKB1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Uchl3Q9JKB1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Uchl3Q9JKB1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Uchl3Q9JKB1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Uchl3Q9JKB1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Uchl3Q9JKB1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Uchl3Q9JKB1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Uchl3Q9JKB1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Uchl3Q9JKB1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Uchl3Q9JKB1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Uchl3Q9JKB1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Uchl3Q9JKB1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Uchl3Q9JKB1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Uchl3Q9JKB1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Uchl3Q9JKB1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Uchl3Q9JKB1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Uchl3Q9JKB1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Uchl3Q9JKB1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Uchl3Q9JKB1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Uchl3Q9JKB1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Uchl3Q9JKB1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Uchl3Q9JKB1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Uchl3Q9JKB1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Uchl3Q9JKB1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Uchl3Q9JKB1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Uchl3Q9JKB1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Uchl3Q9JKB1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Uchl3Q9JKB1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Uchl3Q9JKB1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Uchl3Q9JKB1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Uchl3Q9JKB1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Uchl3Q9JKB1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Uchl3Q9JKB1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Uchl3Q9JKB1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Uchl3Q9JKB1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Uchl3Q9JKB1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Uchl3Q9JKB1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms