Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJR7

Ascl3, Achaete-scute homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl3Q9JJR7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ascl3Q9JJR7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ascl3Q9JJR7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ascl3Q9JJR7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ascl3Q9JJR7 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ascl3Q9JJR7 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ascl3Q9JJR7 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ascl3Q9JJR7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ascl3Q9JJR7 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ascl3Q9JJR7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ascl3Q9JJR7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ascl3Q9JJR7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ascl3Q9JJR7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ascl3Q9JJR7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ascl3Q9JJR7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ascl3Q9JJR7 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ascl3Q9JJR7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ascl3Q9JJR7 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ascl3Q9JJR7 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Ascl3Q9JJR7 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ascl3Q9JJR7 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ascl3Q9JJR7 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ascl3Q9JJR7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ascl3Q9JJR7 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ascl3Q9JJR7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ascl3Q9JJR7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ascl3Q9JJR7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ascl3Q9JJR7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ascl3Q9JJR7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ascl3Q9JJR7 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ascl3Q9JJR7 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ascl3Q9JJR7 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ascl3Q9JJR7 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ascl3Q9JJR7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ascl3Q9JJR7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ascl3Q9JJR7 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ascl3Q9JJR7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ascl3Q9JJR7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ascl3Q9JJR7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ascl3Q9JJR7 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ascl3Q9JJR7 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ascl3Q9JJR7 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ascl3Q9JJR7 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ascl3Q9JJR7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ascl3Q9JJR7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ascl3Q9JJR7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ascl3Q9JJR7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ascl3Q9JJR7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ascl3Q9JJR7 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ascl3Q9JJR7 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ascl3Q9JJR7 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ascl3Q9JJR7 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ascl3Q9JJR7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ascl3Q9JJR7 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ascl3Q9JJR7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ascl3Q9JJR7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ascl3Q9JJR7 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ascl3Q9JJR7 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ascl3Q9JJR7 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ascl3Q9JJR7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ascl3Q9JJR7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ascl3Q9JJR7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ascl3Q9JJR7 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ascl3Q9JJR7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ascl3Q9JJR7 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ascl3Q9JJR7 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ascl3Q9JJR7 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ascl3Q9JJR7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ascl3Q9JJR7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ascl3Q9JJR7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ascl3Q9JJR7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ascl3Q9JJR7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ascl3Q9JJR7 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ascl3Q9JJR7 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ascl3Q9JJR7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ascl3Q9JJR7 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ascl3Q9JJR7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ascl3Q9JJR7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ascl3Q9JJR7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ascl3Q9JJR7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ascl3Q9JJR7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ascl3Q9JJR7 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ascl3Q9JJR7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ascl3Q9JJR7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ascl3Q9JJR7 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ascl3Q9JJR7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ascl3Q9JJR7 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ascl3Q9JJR7 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ascl3Q9JJR7 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ascl3Q9JJR7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ascl3Q9JJR7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ascl3Q9JJR7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ascl3Q9JJR7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ascl3Q9JJR7 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ascl3Q9JJR7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ascl3Q9JJR7 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ascl3Q9JJR7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ascl3Q9JJR7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ascl3Q9JJR7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ascl3Q9JJR7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms