Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF3

Riox1, Ribosomal oxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox1Q9JJF3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Riox1Q9JJF3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Riox1Q9JJF3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Riox1Q9JJF3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Riox1Q9JJF3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Riox1Q9JJF3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Riox1Q9JJF3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Riox1Q9JJF3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Riox1Q9JJF3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Riox1Q9JJF3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Riox1Q9JJF3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Riox1Q9JJF3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Riox1Q9JJF3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Riox1Q9JJF3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Riox1Q9JJF3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Riox1Q9JJF3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Riox1Q9JJF3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Riox1Q9JJF3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Riox1Q9JJF3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Riox1Q9JJF3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Riox1Q9JJF3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Riox1Q9JJF3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Riox1Q9JJF3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Riox1Q9JJF3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Riox1Q9JJF3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Riox1Q9JJF3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Riox1Q9JJF3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Riox1Q9JJF3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Riox1Q9JJF3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Riox1Q9JJF3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Riox1Q9JJF3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Riox1Q9JJF3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Riox1Q9JJF3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Riox1Q9JJF3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Riox1Q9JJF3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Riox1Q9JJF3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Riox1Q9JJF3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Riox1Q9JJF3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Riox1Q9JJF3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Riox1Q9JJF3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Riox1Q9JJF3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Riox1Q9JJF3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Riox1Q9JJF3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Riox1Q9JJF3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Riox1Q9JJF3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Riox1Q9JJF3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Riox1Q9JJF3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Riox1Q9JJF3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Riox1Q9JJF3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Riox1Q9JJF3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Riox1Q9JJF3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Riox1Q9JJF3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Riox1Q9JJF3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Riox1Q9JJF3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Riox1Q9JJF3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Riox1Q9JJF3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Riox1Q9JJF3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Riox1Q9JJF3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Riox1Q9JJF3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Riox1Q9JJF3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Riox1Q9JJF3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Riox1Q9JJF3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Riox1Q9JJF3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Riox1Q9JJF3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Riox1Q9JJF3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Riox1Q9JJF3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Riox1Q9JJF3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Riox1Q9JJF3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Riox1Q9JJF3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Riox1Q9JJF3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Riox1Q9JJF3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Riox1Q9JJF3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Riox1Q9JJF3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Riox1Q9JJF3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Riox1Q9JJF3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Riox1Q9JJF3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Riox1Q9JJF3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Riox1Q9JJF3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Riox1Q9JJF3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Riox1Q9JJF3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Riox1Q9JJF3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Riox1Q9JJF3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Riox1Q9JJF3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Riox1Q9JJF3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Riox1Q9JJF3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Riox1Q9JJF3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Riox1Q9JJF3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Riox1Q9JJF3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Riox1Q9JJF3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Riox1Q9JJF3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Riox1Q9JJF3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Riox1Q9JJF3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Riox1Q9JJF3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Riox1Q9JJF3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Riox1Q9JJF3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Riox1Q9JJF3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Riox1Q9JJF3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Riox1Q9JJF3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Riox1Q9JJF3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Riox1Q9JJF3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms