Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lmbr1Q9JIT0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lmbr1Q9JIT0 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lmbr1Q9JIT0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lmbr1Q9JIT0 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lmbr1Q9JIT0 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Lmbr1Q9JIT0 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lmbr1Q9JIT0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lmbr1Q9JIT0 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lmbr1Q9JIT0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lmbr1Q9JIT0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lmbr1Q9JIT0 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lmbr1Q9JIT0 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lmbr1Q9JIT0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lmbr1Q9JIT0 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lmbr1Q9JIT0 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lmbr1Q9JIT0 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lmbr1Q9JIT0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lmbr1Q9JIT0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lmbr1Q9JIT0 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lmbr1Q9JIT0 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lmbr1Q9JIT0 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lmbr1Q9JIT0 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lmbr1Q9JIT0 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lmbr1Q9JIT0 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lmbr1Q9JIT0 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lmbr1Q9JIT0 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lmbr1Q9JIT0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lmbr1Q9JIT0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lmbr1Q9JIT0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Lmbr1Q9JIT0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lmbr1Q9JIT0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lmbr1Q9JIT0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lmbr1Q9JIT0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lmbr1Q9JIT0 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lmbr1Q9JIT0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lmbr1Q9JIT0 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lmbr1Q9JIT0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lmbr1Q9JIT0 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lmbr1Q9JIT0 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lmbr1Q9JIT0 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lmbr1Q9JIT0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lmbr1Q9JIT0 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Lmbr1Q9JIT0 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Lmbr1Q9JIT0 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Lmbr1Q9JIT0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lmbr1Q9JIT0 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Lmbr1Q9JIT0 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Lmbr1Q9JIT0 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lmbr1Q9JIT0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Lmbr1Q9JIT0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lmbr1Q9JIT0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lmbr1Q9JIT0 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lmbr1Q9JIT0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lmbr1Q9JIT0 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lmbr1Q9JIT0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Lmbr1Q9JIT0 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lmbr1Q9JIT0 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lmbr1Q9JIT0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lmbr1Q9JIT0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lmbr1Q9JIT0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lmbr1Q9JIT0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lmbr1Q9JIT0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lmbr1Q9JIT0 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lmbr1Q9JIT0 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lmbr1Q9JIT0 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Lmbr1Q9JIT0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lmbr1Q9JIT0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lmbr1Q9JIT0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lmbr1Q9JIT0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lmbr1Q9JIT0 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lmbr1Q9JIT0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lmbr1Q9JIT0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lmbr1Q9JIT0 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lmbr1Q9JIT0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lmbr1Q9JIT0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lmbr1Q9JIT0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lmbr1Q9JIT0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lmbr1Q9JIT0 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lmbr1Q9JIT0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lmbr1Q9JIT0 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lmbr1Q9JIT0 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lmbr1Q9JIT0 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lmbr1Q9JIT0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lmbr1Q9JIT0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lmbr1Q9JIT0 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lmbr1Q9JIT0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lmbr1Q9JIT0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lmbr1Q9JIT0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lmbr1Q9JIT0 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Lmbr1Q9JIT0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lmbr1Q9JIT0 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lmbr1Q9JIT0 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lmbr1Q9JIT0 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lmbr1Q9JIT0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lmbr1Q9JIT0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lmbr1Q9JIT0 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Lmbr1Q9JIT0 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lmbr1Q9JIT0 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lmbr1Q9JIT0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms