Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI60

Lrat, Lecithin retinol acyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LratQ9JI60 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LratQ9JI60 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LratQ9JI60 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LratQ9JI60 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LratQ9JI60 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LratQ9JI60 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LratQ9JI60 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LratQ9JI60 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LratQ9JI60 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LratQ9JI60 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LratQ9JI60 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LratQ9JI60 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LratQ9JI60 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LratQ9JI60 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LratQ9JI60 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LratQ9JI60 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LratQ9JI60 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LratQ9JI60 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LratQ9JI60 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LratQ9JI60 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LratQ9JI60 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LratQ9JI60 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LratQ9JI60 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LratQ9JI60 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LratQ9JI60 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LratQ9JI60 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LratQ9JI60 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LratQ9JI60 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LratQ9JI60 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LratQ9JI60 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LratQ9JI60 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LratQ9JI60 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LratQ9JI60 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LratQ9JI60 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LratQ9JI60 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LratQ9JI60 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LratQ9JI60 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LratQ9JI60 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LratQ9JI60 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LratQ9JI60 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LratQ9JI60 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LratQ9JI60 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LratQ9JI60 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LratQ9JI60 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LratQ9JI60 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LratQ9JI60 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LratQ9JI60 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LratQ9JI60 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LratQ9JI60 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LratQ9JI60 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LratQ9JI60 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LratQ9JI60 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LratQ9JI60 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LratQ9JI60 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LratQ9JI60 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LratQ9JI60 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LratQ9JI60 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LratQ9JI60 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LratQ9JI60 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LratQ9JI60 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LratQ9JI60 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LratQ9JI60 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LratQ9JI60 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LratQ9JI60 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LratQ9JI60 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LratQ9JI60 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LratQ9JI60 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LratQ9JI60 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LratQ9JI60 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LratQ9JI60 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LratQ9JI60 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LratQ9JI60 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LratQ9JI60 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LratQ9JI60 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LratQ9JI60 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LratQ9JI60 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LratQ9JI60 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LratQ9JI60 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LratQ9JI60 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LratQ9JI60 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LratQ9JI60 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LratQ9JI60 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LratQ9JI60 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LratQ9JI60 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LratQ9JI60 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LratQ9JI60 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LratQ9JI60 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LratQ9JI60 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LratQ9JI60 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LratQ9JI60 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LratQ9JI60 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LratQ9JI60 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LratQ9JI60 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LratQ9JI60 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LratQ9JI60 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LratQ9JI60 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LratQ9JI60 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LratQ9JI60 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LratQ9JI60 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LratQ9JI60 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms