Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF5

Tcirg1, V-type proton ATPase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcirg1Q9JHF5 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tcirg1Q9JHF5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tcirg1Q9JHF5 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Tcirg1Q9JHF5 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tcirg1Q9JHF5 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tcirg1Q9JHF5 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tcirg1Q9JHF5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tcirg1Q9JHF5 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tcirg1Q9JHF5 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tcirg1Q9JHF5 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tcirg1Q9JHF5 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tcirg1Q9JHF5 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tcirg1Q9JHF5 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tcirg1Q9JHF5 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tcirg1Q9JHF5 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tcirg1Q9JHF5 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tcirg1Q9JHF5 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tcirg1Q9JHF5 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tcirg1Q9JHF5 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tcirg1Q9JHF5 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tcirg1Q9JHF5 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tcirg1Q9JHF5 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tcirg1Q9JHF5 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tcirg1Q9JHF5 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tcirg1Q9JHF5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tcirg1Q9JHF5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tcirg1Q9JHF5 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tcirg1Q9JHF5 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tcirg1Q9JHF5 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tcirg1Q9JHF5 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Tcirg1Q9JHF5 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tcirg1Q9JHF5 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Tcirg1Q9JHF5 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tcirg1Q9JHF5 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tcirg1Q9JHF5 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tcirg1Q9JHF5 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tcirg1Q9JHF5 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Tcirg1Q9JHF5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tcirg1Q9JHF5 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tcirg1Q9JHF5 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tcirg1Q9JHF5 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tcirg1Q9JHF5 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tcirg1Q9JHF5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tcirg1Q9JHF5 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tcirg1Q9JHF5 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tcirg1Q9JHF5 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tcirg1Q9JHF5 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tcirg1Q9JHF5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tcirg1Q9JHF5 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tcirg1Q9JHF5 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tcirg1Q9JHF5 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tcirg1Q9JHF5 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tcirg1Q9JHF5 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tcirg1Q9JHF5 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tcirg1Q9JHF5 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tcirg1Q9JHF5 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tcirg1Q9JHF5 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tcirg1Q9JHF5 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tcirg1Q9JHF5 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tcirg1Q9JHF5 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tcirg1Q9JHF5 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tcirg1Q9JHF5 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tcirg1Q9JHF5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tcirg1Q9JHF5 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tcirg1Q9JHF5 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tcirg1Q9JHF5 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tcirg1Q9JHF5 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Tcirg1Q9JHF5 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tcirg1Q9JHF5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tcirg1Q9JHF5 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tcirg1Q9JHF5 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tcirg1Q9JHF5 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tcirg1Q9JHF5 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tcirg1Q9JHF5 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tcirg1Q9JHF5 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tcirg1Q9JHF5 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tcirg1Q9JHF5 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tcirg1Q9JHF5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tcirg1Q9JHF5 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tcirg1Q9JHF5 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tcirg1Q9JHF5 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tcirg1Q9JHF5 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Tcirg1Q9JHF5 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tcirg1Q9JHF5 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tcirg1Q9JHF5 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tcirg1Q9JHF5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tcirg1Q9JHF5 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tcirg1Q9JHF5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tcirg1Q9JHF5 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tcirg1Q9JHF5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tcirg1Q9JHF5 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tcirg1Q9JHF5 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Tcirg1Q9JHF5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tcirg1Q9JHF5 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tcirg1Q9JHF5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tcirg1Q9JHF5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tcirg1Q9JHF5 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tcirg1Q9JHF5 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tcirg1Q9JHF5 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tcirg1Q9JHF5 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms