Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESX4

Zcchc17, Nucleolar protein of 40 kDa, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc17Q9ESX4 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Zcchc17Q9ESX4 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zcchc17Q9ESX4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zcchc17Q9ESX4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zcchc17Q9ESX4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zcchc17Q9ESX4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zcchc17Q9ESX4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zcchc17Q9ESX4 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zcchc17Q9ESX4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zcchc17Q9ESX4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zcchc17Q9ESX4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zcchc17Q9ESX4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Zcchc17Q9ESX4 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zcchc17Q9ESX4 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zcchc17Q9ESX4 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zcchc17Q9ESX4 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Zcchc17Q9ESX4 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zcchc17Q9ESX4 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Zcchc17Q9ESX4 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zcchc17Q9ESX4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zcchc17Q9ESX4 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zcchc17Q9ESX4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zcchc17Q9ESX4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Zcchc17Q9ESX4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zcchc17Q9ESX4 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Zcchc17Q9ESX4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zcchc17Q9ESX4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zcchc17Q9ESX4 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zcchc17Q9ESX4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zcchc17Q9ESX4 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Zcchc17Q9ESX4 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zcchc17Q9ESX4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zcchc17Q9ESX4 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zcchc17Q9ESX4 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zcchc17Q9ESX4 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zcchc17Q9ESX4 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zcchc17Q9ESX4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zcchc17Q9ESX4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Zcchc17Q9ESX4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zcchc17Q9ESX4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zcchc17Q9ESX4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zcchc17Q9ESX4 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zcchc17Q9ESX4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zcchc17Q9ESX4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zcchc17Q9ESX4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zcchc17Q9ESX4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zcchc17Q9ESX4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zcchc17Q9ESX4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zcchc17Q9ESX4 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zcchc17Q9ESX4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zcchc17Q9ESX4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Zcchc17Q9ESX4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zcchc17Q9ESX4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zcchc17Q9ESX4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zcchc17Q9ESX4 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Zcchc17Q9ESX4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zcchc17Q9ESX4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zcchc17Q9ESX4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zcchc17Q9ESX4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zcchc17Q9ESX4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zcchc17Q9ESX4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zcchc17Q9ESX4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zcchc17Q9ESX4 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zcchc17Q9ESX4 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zcchc17Q9ESX4 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zcchc17Q9ESX4 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zcchc17Q9ESX4 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zcchc17Q9ESX4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zcchc17Q9ESX4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zcchc17Q9ESX4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zcchc17Q9ESX4 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zcchc17Q9ESX4 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zcchc17Q9ESX4 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zcchc17Q9ESX4 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Zcchc17Q9ESX4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Zcchc17Q9ESX4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Zcchc17Q9ESX4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Zcchc17Q9ESX4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Zcchc17Q9ESX4 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zcchc17Q9ESX4 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zcchc17Q9ESX4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zcchc17Q9ESX4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zcchc17Q9ESX4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zcchc17Q9ESX4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zcchc17Q9ESX4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zcchc17Q9ESX4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zcchc17Q9ESX4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zcchc17Q9ESX4 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zcchc17Q9ESX4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zcchc17Q9ESX4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zcchc17Q9ESX4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zcchc17Q9ESX4 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zcchc17Q9ESX4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zcchc17Q9ESX4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zcchc17Q9ESX4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zcchc17Q9ESX4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zcchc17Q9ESX4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zcchc17Q9ESX4 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zcchc17Q9ESX4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zcchc17Q9ESX4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms