Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES34

Ube3b, Ubiquitin-protein ligase E3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3bQ9ES34 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ube3bQ9ES34 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ube3bQ9ES34 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ube3bQ9ES34 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ube3bQ9ES34 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ube3bQ9ES34 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ube3bQ9ES34 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ube3bQ9ES34 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ube3bQ9ES34 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ube3bQ9ES34 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ube3bQ9ES34 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ube3bQ9ES34 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ube3bQ9ES34 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ube3bQ9ES34 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ube3bQ9ES34 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ube3bQ9ES34 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ube3bQ9ES34 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ube3bQ9ES34 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ube3bQ9ES34 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ube3bQ9ES34 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ube3bQ9ES34 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ube3bQ9ES34 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ube3bQ9ES34 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ube3bQ9ES34 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ube3bQ9ES34 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ube3bQ9ES34 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ube3bQ9ES34 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ube3bQ9ES34 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ube3bQ9ES34 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ube3bQ9ES34 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ube3bQ9ES34 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ube3bQ9ES34 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ube3bQ9ES34 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ube3bQ9ES34 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ube3bQ9ES34 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ube3bQ9ES34 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ube3bQ9ES34 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ube3bQ9ES34 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ube3bQ9ES34 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ube3bQ9ES34 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ube3bQ9ES34 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ube3bQ9ES34 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ube3bQ9ES34 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ube3bQ9ES34 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ube3bQ9ES34 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ube3bQ9ES34 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ube3bQ9ES34 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ube3bQ9ES34 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ube3bQ9ES34 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ube3bQ9ES34 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ube3bQ9ES34 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ube3bQ9ES34 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ube3bQ9ES34 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ube3bQ9ES34 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ube3bQ9ES34 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ube3bQ9ES34 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ube3bQ9ES34 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ube3bQ9ES34 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ube3bQ9ES34 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ube3bQ9ES34 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ube3bQ9ES34 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ube3bQ9ES34 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ube3bQ9ES34 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ube3bQ9ES34 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ube3bQ9ES34 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ube3bQ9ES34 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ube3bQ9ES34 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ube3bQ9ES34 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ube3bQ9ES34 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ube3bQ9ES34 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ube3bQ9ES34 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ube3bQ9ES34 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ube3bQ9ES34 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ube3bQ9ES34 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ube3bQ9ES34 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ube3bQ9ES34 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ube3bQ9ES34 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ube3bQ9ES34 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ube3bQ9ES34 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ube3bQ9ES34 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ube3bQ9ES34 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ube3bQ9ES34 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ube3bQ9ES34 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ube3bQ9ES34 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ube3bQ9ES34 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ube3bQ9ES34 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ube3bQ9ES34 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ube3bQ9ES34 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ube3bQ9ES34 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ube3bQ9ES34 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ube3bQ9ES34 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ube3bQ9ES34 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ube3bQ9ES34 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ube3bQ9ES34 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ube3bQ9ES34 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ube3bQ9ES34 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ube3bQ9ES34 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ube3bQ9ES34 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ube3bQ9ES34 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ube3bQ9ES34 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms