Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA6

Tfip11, Tuftelin-interacting protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfip11Q9ERA6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tfip11Q9ERA6 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tfip11Q9ERA6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tfip11Q9ERA6 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tfip11Q9ERA6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tfip11Q9ERA6 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tfip11Q9ERA6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tfip11Q9ERA6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tfip11Q9ERA6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tfip11Q9ERA6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tfip11Q9ERA6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tfip11Q9ERA6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tfip11Q9ERA6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tfip11Q9ERA6 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tfip11Q9ERA6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tfip11Q9ERA6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tfip11Q9ERA6 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tfip11Q9ERA6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tfip11Q9ERA6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tfip11Q9ERA6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tfip11Q9ERA6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tfip11Q9ERA6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tfip11Q9ERA6 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tfip11Q9ERA6 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tfip11Q9ERA6 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tfip11Q9ERA6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tfip11Q9ERA6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tfip11Q9ERA6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tfip11Q9ERA6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tfip11Q9ERA6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tfip11Q9ERA6 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tfip11Q9ERA6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tfip11Q9ERA6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tfip11Q9ERA6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tfip11Q9ERA6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tfip11Q9ERA6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Tfip11Q9ERA6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tfip11Q9ERA6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tfip11Q9ERA6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tfip11Q9ERA6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Tfip11Q9ERA6 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tfip11Q9ERA6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tfip11Q9ERA6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Tfip11Q9ERA6 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Tfip11Q9ERA6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tfip11Q9ERA6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tfip11Q9ERA6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tfip11Q9ERA6 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tfip11Q9ERA6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tfip11Q9ERA6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tfip11Q9ERA6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tfip11Q9ERA6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tfip11Q9ERA6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tfip11Q9ERA6 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tfip11Q9ERA6 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tfip11Q9ERA6 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tfip11Q9ERA6 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tfip11Q9ERA6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tfip11Q9ERA6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tfip11Q9ERA6 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tfip11Q9ERA6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Tfip11Q9ERA6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tfip11Q9ERA6 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tfip11Q9ERA6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tfip11Q9ERA6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tfip11Q9ERA6 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tfip11Q9ERA6 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tfip11Q9ERA6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tfip11Q9ERA6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tfip11Q9ERA6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tfip11Q9ERA6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tfip11Q9ERA6 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tfip11Q9ERA6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Tfip11Q9ERA6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tfip11Q9ERA6 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tfip11Q9ERA6 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tfip11Q9ERA6 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tfip11Q9ERA6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tfip11Q9ERA6 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tfip11Q9ERA6 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tfip11Q9ERA6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tfip11Q9ERA6 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Tfip11Q9ERA6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tfip11Q9ERA6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tfip11Q9ERA6 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tfip11Q9ERA6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tfip11Q9ERA6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tfip11Q9ERA6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tfip11Q9ERA6 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tfip11Q9ERA6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tfip11Q9ERA6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tfip11Q9ERA6 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tfip11Q9ERA6 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tfip11Q9ERA6 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tfip11Q9ERA6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tfip11Q9ERA6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tfip11Q9ERA6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tfip11Q9ERA6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tfip11Q9ERA6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Tfip11Q9ERA6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms