Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ47

Vmn1r44, Vomeronasal type-1 receptor 44, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r44Q9EQ47 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vmn1r44Q9EQ47 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vmn1r44Q9EQ47 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vmn1r44Q9EQ47 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vmn1r44Q9EQ47 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Vmn1r44Q9EQ47 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vmn1r44Q9EQ47 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r44Q9EQ47 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r44Q9EQ47 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r44Q9EQ47 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r44Q9EQ47 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r44Q9EQ47 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r44Q9EQ47 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r44Q9EQ47 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r44Q9EQ47 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r44Q9EQ47 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r44Q9EQ47 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r44Q9EQ47 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r44Q9EQ47 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r44Q9EQ47 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r44Q9EQ47 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r44Q9EQ47 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r44Q9EQ47 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r44Q9EQ47 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r44Q9EQ47 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r44Q9EQ47 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r44Q9EQ47 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r44Q9EQ47 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r44Q9EQ47 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r44Q9EQ47 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r44Q9EQ47 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r44Q9EQ47 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r44Q9EQ47 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r44Q9EQ47 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r44Q9EQ47 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r44Q9EQ47 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r44Q9EQ47 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r44Q9EQ47 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r44Q9EQ47 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r44Q9EQ47 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r44Q9EQ47 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r44Q9EQ47 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r44Q9EQ47 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r44Q9EQ47 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r44Q9EQ47 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r44Q9EQ47 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r44Q9EQ47 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r44Q9EQ47 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r44Q9EQ47 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r44Q9EQ47 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r44Q9EQ47 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r44Q9EQ47 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r44Q9EQ47 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r44Q9EQ47 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r44Q9EQ47 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r44Q9EQ47 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r44Q9EQ47 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r44Q9EQ47 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r44Q9EQ47 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r44Q9EQ47 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r44Q9EQ47 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r44Q9EQ47 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r44Q9EQ47 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r44Q9EQ47 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r44Q9EQ47 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r44Q9EQ47 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r44Q9EQ47 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r44Q9EQ47 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r44Q9EQ47 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r44Q9EQ47 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r44Q9EQ47 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r44Q9EQ47 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r44Q9EQ47 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r44Q9EQ47 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r44Q9EQ47 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r44Q9EQ47 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r44Q9EQ47 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r44Q9EQ47 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r44Q9EQ47 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r44Q9EQ47 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms