Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPB8

Vmn1r54, Vomeronasal type-1 receptor 54, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r54Q9EPB8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r54Q9EPB8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r54Q9EPB8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r54Q9EPB8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r54Q9EPB8 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r54Q9EPB8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r54Q9EPB8 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r54Q9EPB8 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r54Q9EPB8 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r54Q9EPB8 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r54Q9EPB8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r54Q9EPB8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r54Q9EPB8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r54Q9EPB8 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r54Q9EPB8 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r54Q9EPB8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r54Q9EPB8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r54Q9EPB8 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r54Q9EPB8 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r54Q9EPB8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r54Q9EPB8 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r54Q9EPB8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r54Q9EPB8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r54Q9EPB8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r54Q9EPB8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r54Q9EPB8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r54Q9EPB8 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r54Q9EPB8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r54Q9EPB8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r54Q9EPB8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r54Q9EPB8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r54Q9EPB8 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r54Q9EPB8 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r54Q9EPB8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r54Q9EPB8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r54Q9EPB8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r54Q9EPB8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r54Q9EPB8 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r54Q9EPB8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r54Q9EPB8 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r54Q9EPB8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r54Q9EPB8 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r54Q9EPB8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r54Q9EPB8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r54Q9EPB8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r54Q9EPB8 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r54Q9EPB8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r54Q9EPB8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r54Q9EPB8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r54Q9EPB8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r54Q9EPB8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r54Q9EPB8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r54Q9EPB8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r54Q9EPB8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r54Q9EPB8 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r54Q9EPB8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r54Q9EPB8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r54Q9EPB8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r54Q9EPB8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r54Q9EPB8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r54Q9EPB8 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r54Q9EPB8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r54Q9EPB8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r54Q9EPB8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r54Q9EPB8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r54Q9EPB8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r54Q9EPB8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r54Q9EPB8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r54Q9EPB8 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r54Q9EPB8 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r54Q9EPB8 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r54Q9EPB8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r54Q9EPB8 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r54Q9EPB8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r54Q9EPB8 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r54Q9EPB8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r54Q9EPB8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r54Q9EPB8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r54Q9EPB8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r54Q9EPB8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r54Q9EPB8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r54Q9EPB8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r54Q9EPB8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r54Q9EPB8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r54Q9EPB8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r54Q9EPB8 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r54Q9EPB8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r54Q9EPB8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r54Q9EPB8 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r54Q9EPB8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r54Q9EPB8 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r54Q9EPB8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r54Q9EPB8 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r54Q9EPB8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r54Q9EPB8 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r54Q9EPB8 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r54Q9EPB8 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r54Q9EPB8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r54Q9EPB8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r54Q9EPB8 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms